[发明专利]无损检测细胞miRNA的表达量及确定细胞类型与状态的方法有效

专利信息
申请号: 201210258472.8 申请日: 2012-07-24
公开(公告)号: CN103571929A 公开(公告)日: 2014-02-12
发明(设计)人: 周琪;王秀杰;张映 申请(专利权)人: 中国科学院动物研究所;中国科学院遗传与发育生物学研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 代理人: 郭广迅
地址: 100101 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 无损 检测 细胞 mirna 表达 确定 类型 状态 方法
【权利要求书】:

1.一种快速、简便、对细胞无损地检测细胞中miRNA的表达量和确定细胞类型与状态的方法,其是通过检测细胞培养基中的miRNA的表达量而实现的,所述培养基中miRNA表达量的检测通过包括以下步骤的方法进行:

1)收集过夜培养细胞的培养基,离心,取上清,再将其过滤;

2)用步骤1)获得的过滤后的上清液提取RNA;

3)将步骤2)提取的RNA进行逆转录反应,得到cDNA溶液;

4)将步骤3)得到的cDNA溶液进行PCR扩增反应,再用荧光定量PCR仪检测,从而得到其中miRNA的表达量。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤1)中,所述细胞选自人或动物胚胎成纤维细胞、人或动物诱导多能性干细胞、动物胚胎干细胞、人或动物成体干细胞、转分化来源的人或动物细胞、人或动物的分化细胞或肿瘤疾病细胞或疾病干细胞中的一种或多种;

优选地,所述动物诱导多能性干细胞选自2N-iPS细胞和4N-iPS细胞,更优选地,所述2N-iPS细胞包括细胞系IP20D-3和IP36D-3,所述4N-iPS细胞包括细胞系IP14D-1、IP14D-6、IP16DT-2A和IP14DN-5;

优选地,所述动物胚胎干细胞为ESC2和/或CL11;

优选地,所述动物胚胎成纤维细胞为小鼠胚胎成纤维细胞;

优选地,人或动物的分化细胞选自动物尾尖细胞和/或小鼠神经前体细胞,更优选地,所述动物尾尖细胞为小鼠尾尖细胞;所述神经前体细胞为小鼠神经前体细胞;

优选地,所述肿瘤细胞为人乳腺癌细胞。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,在步骤1)中,当所述细胞为小鼠胚胎成纤维细胞、小鼠尾尖细胞或人乳腺癌细胞时,所述培养细胞的培养基为450ml DMEM加入50ml FBS,5ml 100x青链霉素的培养基;或

当所述细胞为小鼠神经前体细胞时,所述培养细胞的培养基为添加有EGF和bFGF的N2B27培养基,优选地,所述EGF和bFGF的浓度均为20ng/ml;或

当所述细胞为小鼠胚胎干细胞或小鼠iPS诱导多能性干细胞时,所述培养细胞的培养基为含15%FBS的DMEM培养基,优选地,所述DMEM培养基中还添加有1000U的白血病抑制因子、2mM的谷氨酰胺、1mM的丙酮酸钠、0.1mM的β-巯基乙醇和0.1mM的非必需氨基酸。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤4)中,所述PCR扩增反应的上游引物为miRNA特异扩增的上游引物,所述下游引物为通用引物,优选地,所述通用引物为商品名AOMD-Q050,GeneCopoeia的通用引物。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述miRNA的特异扩增的上游引物为miRNA-292-3P、miRNA-294-3P、miRNA-323-3P或miRNA-21-5P的特异扩增的上游引物;优选地,所述miRNA-292-3P的特异扩增的上游引物为商品名为MmiRQP0944,GeneCopoeia的引物,优选地,所述miRNA-294-3P的特异扩增的上游引物为商品名为MmiRQP0947,GeneCopoeia的引物,优选地,所述miRNA-323-3P的特异扩增的上游引物为商品名为MmiRQP0410,GeneCopoeia的引物,优选地,所述miRNA-21-5P的特异扩增的上游引物为HmiRQP0316,GeneCopoeia的引物。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤1)通过包括以下步骤的方法进行:收集过夜培养细胞的培养基5-10ml,于2000-3000rpm离心,取上清,再将其用0.45μm的过滤器过滤。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,在步骤1)中,收集过夜培养细胞的培养基5ml,于2000rpm离心。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤2)中,用TRIZOL LS试剂提取RNA。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤3)中,用All-in-OneTMmiRNA反转录试剂盒进行逆转录反应。

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