[发明专利]FOXC1基因突变体及其应用有效
申请号: | 201210262652.3 | 申请日: | 2012-07-26 |
公开(公告)号: | CN103571847A | 公开(公告)日: | 2014-02-12 |
发明(设计)人: | 陈建欢;张铭志;管李萍;林伟涛;王丽娟;吴斌;陈浩宇;黄楚开;郑玉倩;彭智培;王俊;汪建;杨焕明 | 申请(专利权)人: | 汕头大学·香港中文大学联合汕头国际眼科中心;深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68;C12Q1/02;C12M1/34;C07K14/47 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 515041 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | foxc1 基因 突变体 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及FOXC1基因突变体及其应用。具体地,本发明涉及分离的编码FOXC1突变体的核酸,分离的多肽,筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的方法,筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的系统,用于筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的试剂盒以及筛选治疗或预防Axenfeld-Rieger综合症的药物的方法。
背景技术
Axenfeld-Rieger综合症是以双眼发育性缺陷,伴有或者不伴有全身发育异常为特点的发育性疾病,表现为双眼发育性缺陷,继发性青光眼,可伴有全身发育异常,多为牙骨和面骨异常,为常染色体的显性遗传,多有家族史,男女相同。眼部的临床特点表现为:双眼发病,视力减退,角膜后胚胎环,前房角异常,虹膜角膜粘连,虹膜发育异常,无瞳,瞳孔异位,多瞳等。全身异常的临床特点主要表现为:牙齿异常如小牙、牙齿发育不全或少牙等;多余的脐周皮肤;颅面畸形如上颌骨发育不全。
到目前为止,已确定PITX2基因和FOXC1基因是与Axenfeld-Rieger综合症相关的基因,且其均为转录因子。但仍存在着相当一部分未知致病基因位点,预计在人类中可能仍然存在70多个位点与Axenfeld-Rieger综合症相关。
因而,目前对Axenfeld-Rieger综合症的研究仍有待深入。
发明内容
本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此,本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的方法。
本发明是基于发明人的下列工作而完成的:发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了Axenfeld-Rieger综合症新的致病基因突变(FOXC1c.168delC)。
根据本发明的第一方面,本发明提出了一种分离的编码FOXC1突变体的核酸。根据本发明的实施例,该核酸与SEQ ID NO:1相比,具有c.168delC突变。根据本发明的实施例,发明人确定了FOXC1的新突变体,该新突变体与Axenfeld-Rieger综合症的发病密切相关,从而通过检测该新突变体在生物样品中是否存在,可以有效地检测生物样品是否易感Axenfeld-Rieger综合症。
根据本发明的第二方面,本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例,该多肽是由根据本发明实施例的编码FOXC1突变体的核酸所编码的,其与SEQ ID NO:2相比,阅读框发生改变,即p.Pro56Argfs*22,具体地,从第56位氨基酸开始,由脯氨酸突变为精氨酸,新的读码框终止于第77位,即终止于从56位氨基酸开始算起的第22位氨基酸。通过检测生物样品中是否表达该多肽,可以有效地检测生物样品是否易感Axenfeld-Rieger综合症。
根据本发明的第三方面,本发明提出了一种筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的方法。根据本发明的实施例,该方法包括以下步骤:从所述生物样品提取核酸样本;确定所述核酸样本的核酸序列;所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有c.168delC突变是所述生物样品易感Axenfeld-Rieger综合症的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的方法,可以有效地筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品。
根据本发明的第四方面,本发明提出了一种筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的系统。根据本发明的实施例,该系统包括:核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,是否具有c.168delC突变,判断所述生物样品是否易感Axenfeld-Rieger综合症。利用该系统,能够有效地实施前述筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品的方法,从而可以有效地筛选易感Axenfeld-Rieger综合症的生物样品。
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