[发明专利]OB基因用作为鹅脂肪性状遗传标记的用途无效
申请号: | 201210306638.9 | 申请日: | 2012-08-27 |
公开(公告)号: | CN102911942A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 曲湘勇;蒋隽;何俊;贺长青 | 申请(专利权)人: | 湖南农业大学;曲湘勇 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68;A01K67/027 |
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地址: | 410128 湖南省长*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ob 基因 用作 脂肪 性状 遗传 标记 用途 | ||
技术领域
本发明涉及鹅的分子生物学技术及育种领域,具体是涉及测定与腹脂重和腹脂率等相关特征的遗传标记的存在,更具体地说,是涉及测定显示该些特征的OB基因的差异,再进一步具体地说,是测定OB基因中的多态性,即与腹脂重和腹脂率相关的鹅OB(obese)基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,缩写为SNP)的存在。
背景技术
现代家禽遗传育种理论和应用的发展,使肉用家禽特别是肉鸡、肉鸭的生长速度和饲料效率大幅度提高,生产效率与工厂化生产逐相适应。但同时也容易带来胴体腹部脂肪和皮下脂肪的大量沉积,导致饲料能量的浪费和胴体品质不佳。
OB(obese)基因编码一种瘦蛋白质(Leptin)的肽类激素,可抑制脂肪蓄积和维持脂肪细胞大小正常。目前有许多关于人、鼠OB基因以及少量关于猪OB基因的研究报道,但家禽OB基因的研究报道还鲜见。OB(obese receptor)基因在Lepein的信号转导起极重要作用,它与机体脂肪沉积有关,故OB基因可作为脂肪沉积候选基因。鸡OB基因的cDNA于1998年Taouis等克隆和测序,编码长度492bp,编码163个氨基酸,含18个氨基酸信号肽,成鸡Leptin由146氨基酸组成。Ashwell等用Northern检测发现,鸡的Leptin在脂肪组织和肝脏中都有表达。鸡OB的cDNA于2000年Guy Horev等和Takeshi等被克隆,与其他哺乳动物OB核苷酸序列的同源性平均为60%,Dunn等将鸡的OB基因定位于8号染色体上。顾志良等报道了对鸡的OB基因的外显子9的部分序列进行克隆和测序,发现一个碱基有突变,产生了多态性,但氨基酸序列没有改变(沉默突变)。顾志良等进一步用PCR-SSCP方法研究不同品种鸡的OB基因表明:北京油鸡AA基因型频率与其它鸡种存在差异,高脂系A基因频率比低脂系高,并推测基因A可能与沉积较多腹脂有关。李志辉等研究结果表明,鸡OB基因外显子9的SNPs基因型对肉鸡腹脂重和腹脂率有显著影响,可以用于鸡脂肪性状的标记辅助选择。
目前,有关鹅的DNA遗传标记、遗传多样性和相关功能基因的研究相对鸡来说还很少,且没有关于鹅OB基因的研究报道。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是:针对上述现有技术的不足,提供一种OB基因及其作为鹅脂肪性状遗传标记的用途;同时筛选与鹅脂肪沉积相关的SNP,以期应用于标记辅助选择或标记辅助渗入,并提供上述遗传标记在鹅标记辅助选择中的应用。
为了解决上述技术问题,本发明所采用的技术方案是:一种OB基因,是与表示鹅脂肪性状的腹脂重和腹脂率和相关的基因。上述OB基因序列的第151bp处有一个A→G的突变,导致多态性的存在。
克隆OB基因和检测151A-151G碱基处突变所用引物的序列如下:
正向引物:5′-TGCCAGATCTTCCAGGATGA-3′,
反向引物:5′-GAGATTCTGAGGTCATTGGC-3′。
上述OB基因在鹅遗传标记辅助选择中的应用。
一种鉴定鹅脂肪性状的遗传标记的方法,该鹅具有与表示鹅脂肪性状的腹脂重和腹脂率相关的基因,该方法包括测定从鹅获得的核酸样品中OB基因中多态性的存在,该多态性是与表示鹅脂肪性状指标的腹脂重和腹脂率相关的多态性,该多态性在OB基因序列的58bp处有一个T→G的突变。
上述方法包含克隆得到一个如权利要求1所述OB基因的DNA序列,扩增目的片断长度226bp,第58碱基处有一个碱基突变T58-G58。
克隆OB基因和检测T58-G58碱基处突变所用引物的序列为:
正向引物:5′-TGCCAGATCTTCCAGGATGA-3′,
反向引物:5′-GAGATTCTGAGGTCATTGGC-3′。
上述方法在鹅育种中的应用。
现代家禽遗传育种理论和应用的发展,使肉用家禽特别是肉鸡、肉鸭的生长速度和饲料效率大幅度提高,生产效率与工厂化生产逐相适应。但同时也容易带来胴体腹部脂肪和皮下脂肪的大量沉积,导致饲料能量的浪费和胴体品质的不佳。针对这个问题,本发明人选择鹅作为研究对象,采用分子生物学的方法筛选鹅脂肪性状相关基因,其步骤如下:
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