[发明专利]一种海水中重金属镉污染的生物学灵敏检测方法有效
申请号: | 201210316610.3 | 申请日: | 2012-08-31 |
公开(公告)号: | CN102808036A | 公开(公告)日: | 2012-12-05 |
发明(设计)人: | 潘宝平;张丽岩;罗凯娅 | 申请(专利权)人: | 天津师范大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 | 代理人: | 朱红星 |
地址: | 300387 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 海水 重金属 污染 生物学 灵敏 检测 方法 | ||
1.一种用于监测海水中重金属镉污染的热休克蛋白HSP-70实时荧光定量PCR反应的特异性引物,其特征在于:
上游引物为:HSP-70-RT-F:5'-CTGCTTACTTCAACGACTCCC-3';
下游引物为:HSP-70-RT-R:5'-CTTTTTGTCAAGACCATAGGC-3';
作为内参基因的青蛤β-actin基因特异性上下游引物为:
β-actin-S:5'-CACCACAACTGCCGAGAG-3';
β-actin-A:5'-CCGATAGTGATGACCTGACC-3'。
2.一种采用权利要求1所述特异性PCR引物检测海水中重金属镉的生物学方法,其特征在于按如下步骤进行;
(1)以青蛤作为用于重金属镉污染监测的指示生物样本;
(2)样本总RNA提取与纯化:采用通用的RNA提取方法和纯化方法,从青蛤肝脏提取得到纯化的肝脏总RNA;
(3)cDNA第一链合成:以青蛤肝脏中总RNA为模板合成cDNA第一链,反应体系为25μL;
(4)实时荧光PCR检测:以上述合成的cDNA第一链为模板,根据所述的特异性引物和内参引物,进行实时荧光PCR扩增反应,获取各管Ct值(Cycle threshold指每个反应管内的荧光信号达到设定阈值所经历的循环数);
实时荧光PCR扩增体系设置如下:
实时定量荧光PCR扩增参数设置如下;
Hold(初期变性):Cycle(循环数):1
95℃ 30秒
3 Step PCR(扩增):Cycle(循环数):40
95℃ 5秒
55℃ 30秒
72℃ 30秒
Dissociation;
(5)青蛤肝脏HSP70基因的相对表达量计算:实时荧光PCR完成后,根据仪器自动记录的每管Ct值,使用以下公式计算;
HSP70基因相对表达量=2-△△Ct;
△Ct=Ct HSP70-Ct β-actin;
△△Ct=(CtHSP70-Ctβ-actin)实验组-(CtHSP70- Ctβ-actin)对照组;
2-△△Ct计算实验组模板中HSP70基因的量相对于对照组的变化量,取实验均值,即为青蛤肝脏HSP70基因的相对表达量。
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