[发明专利]一种海水中重金属镉污染的生物学灵敏检测方法有效

专利信息
申请号: 201210316610.3 申请日: 2012-08-31
公开(公告)号: CN102808036A 公开(公告)日: 2012-12-05
发明(设计)人: 潘宝平;张丽岩;罗凯娅 申请(专利权)人: 天津师范大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64
代理公司: 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 代理人: 朱红星
地址: 300387 *** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 一种 海水 重金属 污染 生物学 灵敏 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种用于监测海水中重金属镉污染的热休克蛋白HSP-70实时荧光定量PCR反应的特异性引物,其特征在于:

上游引物为:HSP-70-RT-F:5'-CTGCTTACTTCAACGACTCCC-3';

下游引物为:HSP-70-RT-R:5'-CTTTTTGTCAAGACCATAGGC-3';

作为内参基因的青蛤β-actin基因特异性上下游引物为:

β-actin-S:5'-CACCACAACTGCCGAGAG-3';

β-actin-A:5'-CCGATAGTGATGACCTGACC-3'。

2.一种采用权利要求1所述特异性PCR引物检测海水中重金属镉的生物学方法,其特征在于按如下步骤进行;

(1)以青蛤作为用于重金属镉污染监测的指示生物样本;

(2)样本总RNA提取与纯化:采用通用的RNA提取方法和纯化方法,从青蛤肝脏提取得到纯化的肝脏总RNA;

(3)cDNA第一链合成:以青蛤肝脏中总RNA为模板合成cDNA第一链,反应体系为25μL;

(4)实时荧光PCR检测:以上述合成的cDNA第一链为模板,根据所述的特异性引物和内参引物,进行实时荧光PCR扩增反应,获取各管Ct值(Cycle threshold指每个反应管内的荧光信号达到设定阈值所经历的循环数);

实时荧光PCR扩增体系设置如下:

试剂使用量终浓度SYBR? Premix DimerEraser?(2×)荧光PCR混合物12.5 μl×1PCR Forward Primer(10 μM)正向引物0.75 μl0.3 μM×1PCR Reverse Primer(10 μM)反向引物0.75 μl0.3 μM×1Template(<100 ng)模板2 μl×2dH2O 灭菌蒸馏水9 μl Total  Volume 总体积25 μl×3

实时定量荧光PCR扩增参数设置如下;

Hold(初期变性):Cycle(循环数):1 

95℃ 30秒 

3 Step PCR(扩增):Cycle(循环数):40 

95℃ 5秒 

55℃ 30秒 

72℃ 30秒 

Dissociation;

(5)青蛤肝脏HSP70基因的相对表达量计算:实时荧光PCR完成后,根据仪器自动记录的每管Ct值,使用以下公式计算;

HSP70基因相对表达量=2-△△Ct

 △Ct=Ct HSP70-Ct β-actin;

△△Ct=(CtHSP70-Ctβ-actin)实验组-(CtHSP70- Ctβ-actin)对照组;

2-△△Ct计算实验组模板中HSP70基因的量相对于对照组的变化量,取实验均值,即为青蛤肝脏HSP70基因的相对表达量。

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