[发明专利]芝麻栽培种与Sesamum radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法有效
申请号: | 201210318496.8 | 申请日: | 2012-08-31 |
公开(公告)号: | CN102965431A | 公开(公告)日: | 2013-03-13 |
发明(设计)人: | 张海洋;苗红梅;张体德;魏利斌;李春;琚铭;王慧丽 | 申请(专利权)人: | 河南省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州睿信知识产权代理有限公司 41119 | 代理人: | 牛爱周 |
地址: | 450002 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 芝麻 栽培 sesamum radiatum 野生 远缘 杂交 后代 分子 鉴定 方法 | ||
1.检测芝麻栽培种与Sesame radiatum野生种远缘杂交后代的的SSR引物,包括:
引物对HS209
正向引物序列:5’-GCAAGAAGCCGACATGTTTA-3’(Tm=53.35℃)
反向引物序列:5’-ACTCCAATTCCTCCACCAAG-3’(Tm=55.4℃)。
2.一种如权利要求1所述的引物用于芝麻栽培种与Sesame radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)挑选饱满健康的芝麻栽培种(Sesame indicum L.,2n=26)与野生种(Sesame radiatum,2n=64)种子,6月播种后于7月下旬植株进入花期,进行人工授粉杂交,采用组织培养方法对杂交后代幼胚进行培养,获得远缘杂交F1后代;
(2)提取步骤(1)中芝麻栽培种(Sesame indicum L.,2n=26)、野生种(Sesame radiatum,2n=64)及杂交后代F1基因组DNA,作为模板备用;
(3)将步骤(2)提取的DNA模板应用于PCR反应体系,运行PCR扩增程序,在引物对HS209的引导下,得到PCR反应产物;
(4)将步骤(3)的PCR反应产物进行凝胶电泳检测,检测结果有栽培种特异性条带210bp和野生种特异性条带200bp、230bp的为真杂种;其余则为假杂种。
3.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的基因组DNA的提取方法:取植株叶片,加入预冷的提取缓冲液,研磨,4℃离心,弃上清,于沉淀中加入预热的裂解缓冲液,65℃水浴,加入氯仿/异戊醇混合液,混匀,15℃离心,取上清,加预冷的异丙醇,混匀,静置,离心,弃上清,于沉淀中加入乙醇洗涤,离心,倒掉上清后干燥,加TE缓冲液,4℃溶解DNA30min以上,于20℃保存备用。
4.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的提取缓冲液包括:0.35MGlucose,0.1M Tris-HCl,5mM Na-EDTA,2%PVP,1%(V/V)β-Me,余量为无菌超纯水。
5.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的裂解缓冲液包括:1.4MNaCl,0.1M Tris-HCl,20mM Na-EDTA,2%CTAB,2%PVP,1%(V/V)β-Me,余量为无菌超纯水。
6.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的TE缓冲液包括:10mMTris-HCl(PH 8.0),1mM EDTA(PH 8.0),余量为无菌超纯水。
7.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的PCR反应体系为:DNA模版50ng,10×Buffer 1μL,10mmol·L-1dNTPs 0.2μL,10μg·L-1引物对HS2091μL,2.5U·μL-1Taq DNApolymerase 0.5μL,加入无菌超纯水至终体积10μL。
8.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的PCR扩增程序为:94℃变性3min,94℃变性l min,58℃退火45s,72℃延伸60s,30个循环,72℃总延伸10min;4℃保存。
9.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,凝胶电泳检测为:聚丙烯酰胺凝胶浓度为10%,电泳缓冲液为1×TBE,150V恒压电泳2小时,电泳结束后,凝固定先胶,再银染,漂洗,显色,漂洗凝胶后记录读取数据。
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