[发明专利]芝麻栽培种与Sesamum radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法有效

专利信息
申请号: 201210318496.8 申请日: 2012-08-31
公开(公告)号: CN102965431A 公开(公告)日: 2013-03-13
发明(设计)人: 张海洋;苗红梅;张体德;魏利斌;李春;琚铭;王慧丽 申请(专利权)人: 河南省农业科学院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 郑州睿信知识产权代理有限公司 41119 代理人: 牛爱周
地址: 450002 *** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 芝麻 栽培 sesamum radiatum 野生 远缘 杂交 后代 分子 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.检测芝麻栽培种与Sesame radiatum野生种远缘杂交后代的的SSR引物,包括:

引物对HS209

正向引物序列:5’-GCAAGAAGCCGACATGTTTA-3’(Tm=53.35℃)

反向引物序列:5’-ACTCCAATTCCTCCACCAAG-3’(Tm=55.4℃)。

2.一种如权利要求1所述的引物用于芝麻栽培种与Sesame radiatum野生种远缘杂交后代的分子鉴定方法,其特征在于,具体步骤如下:

(1)挑选饱满健康的芝麻栽培种(Sesame indicum L.,2n=26)与野生种(Sesame radiatum,2n=64)种子,6月播种后于7月下旬植株进入花期,进行人工授粉杂交,采用组织培养方法对杂交后代幼胚进行培养,获得远缘杂交F1后代;

(2)提取步骤(1)中芝麻栽培种(Sesame indicum L.,2n=26)、野生种(Sesame radiatum,2n=64)及杂交后代F1基因组DNA,作为模板备用;

(3)将步骤(2)提取的DNA模板应用于PCR反应体系,运行PCR扩增程序,在引物对HS209的引导下,得到PCR反应产物;

(4)将步骤(3)的PCR反应产物进行凝胶电泳检测,检测结果有栽培种特异性条带210bp和野生种特异性条带200bp、230bp的为真杂种;其余则为假杂种。

3.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的基因组DNA的提取方法:取植株叶片,加入预冷的提取缓冲液,研磨,4℃离心,弃上清,于沉淀中加入预热的裂解缓冲液,65℃水浴,加入氯仿/异戊醇混合液,混匀,15℃离心,取上清,加预冷的异丙醇,混匀,静置,离心,弃上清,于沉淀中加入乙醇洗涤,离心,倒掉上清后干燥,加TE缓冲液,4℃溶解DNA30min以上,于20℃保存备用。

4.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的提取缓冲液包括:0.35MGlucose,0.1M Tris-HCl,5mM Na-EDTA,2%PVP,1%(V/V)β-Me,余量为无菌超纯水。

5.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的裂解缓冲液包括:1.4MNaCl,0.1M Tris-HCl,20mM Na-EDTA,2%CTAB,2%PVP,1%(V/V)β-Me,余量为无菌超纯水。

6.根据权利要求3所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的TE缓冲液包括:10mMTris-HCl(PH 8.0),1mM EDTA(PH 8.0),余量为无菌超纯水。

7.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的PCR反应体系为:DNA模版50ng,10×Buffer 1μL,10mmol·L-1dNTPs 0.2μL,10μg·L-1引物对HS2091μL,2.5U·μL-1Taq DNApolymerase 0.5μL,加入无菌超纯水至终体积10μL。

8.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,所述的PCR扩增程序为:94℃变性3min,94℃变性l min,58℃退火45s,72℃延伸60s,30个循环,72℃总延伸10min;4℃保存。

9.根据权利要求2所述的分子鉴定方法,其特征在于,凝胶电泳检测为:聚丙烯酰胺凝胶浓度为10%,电泳缓冲液为1×TBE,150V恒压电泳2小时,电泳结束后,凝固定先胶,再银染,漂洗,显色,漂洗凝胶后记录读取数据。

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