[发明专利]一种香菇闵丰1号菌种的SSR标记指纹图谱与应用有效
申请号: | 201210333245.7 | 申请日: | 2012-09-11 |
公开(公告)号: | CN102851373A | 公开(公告)日: | 2013-01-02 |
发明(设计)人: | 宋春艳;谭琦;尚晓冬;鲍大鹏;杨慧;章炉军;张丹;巫萍 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
地址: | 201403 上海市奉贤区金齐路*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 香菇 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 应用 | ||
技术领域
本发明属于香菇菌种的检测领域,特别涉及一种香菇闵丰1号菌种的SSR标记指纹图谱与应用。
背景技术
我国香菇产量已从1983年的1.95万吨迅速发展到2005年的242万吨,占全球香菇总产量的70%以上,改写了世界食用菌产量的排行榜,并不断缩小与排行第一的双孢蘑菇产量差距,有专家预测,由于中国香菇产业的迅猛发展,在近10年内其将成为世界产量最高的食用菌。中国香菇以其惊人的发展速度,优质的品质及低廉的成本为世界菇业人士瞩目,中国香菇已风靡世界。
优质菌种在香菇单产和质量中的贡献率举足轻重,这决定了香菇菌种在香菇产业中的重要地位。1999年我国签署了《国际植物新品种保护法》,这不仅要求我们尊重其它国家的品种知识产权,同时也要加强保护我们国家自己的品种知识产权,为了建立食用菌新品种登记制度来真正保护我国的品种产权,必须首先建立成熟的品种鉴定技术,为新品种登记奠定基础。尤其日本2004年4月1日开始实行《种苗法修正案》,对我国食用菌尤其是香菇的出口构成了极大的威胁。就国内而言,香菇栽培菌种“同种异名,异种同名”的现象,不仅给菇农带来了极大的损失,影响了他们的栽培积极性,也极大地影响了中国香菇的快速发展;而且,随着大规模的工厂化栽培方式的出现,对香菇栽培菌株质量的要求越来越高,需要发展更为简便、快速、准确的菌株鉴定技术,以保证每批次的用种都准确无误。
面对这种局势,就需要我们进一步加快菌种鉴定技术的研究,在香菇的研究中引进更为有效的菌种鉴定体系。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种香菇闵丰1号菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用,该指纹图谱与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短,准确性高,重复性好的优点。
本发明的一种香菇闵丰1号菌种的SSR标记指纹图谱,该指纹图谱由7对SSR标记组成,是基于香菇基因组简单重复序列片段开发SSR引物,扩增带型好,重复性高的SSR引物,标记详细信息如表1。
表1SSR标记详细信息列表
本发明的一种香菇闵丰1号菌种的SSR标记指纹图谱的应用,是利用香菇基因组简单重复序列片段开发的7对SSR引物,通过对收集的25份国审香菇栽培品种的SSR引物带型扩增,本发明确定了7对SSR引物在香菇闵丰1号菌种中扩增出的等位片段的数量并编号(表2),通过不同SSR等位片段的编号组合可有效识别闵丰1号菌种(图2-8)。通过对照50bp DNAladder可确定各SSR引物扩增的等位片段的相对分子量,存在闵丰1号菌种特异SSR等位片段组合的菌种,即是香菇闵丰1号菌种,该菌种的编号组合为:(1+2)(1+4)(1+2)2122。
表2SSR引物扩增的等位片段信息汇总表
有益效果
本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短,准确性高,重复性好的优点。检测所需时间只需要3~4天,而常规的拮抗试验所需时间至少需要两周时间,出菇试验则需要至少3个月的时间;该方法在所收集的我国25个通过国审的香菇主栽菌种中具有闵丰1号菌种的专一性,具有良好的应用前景。
附图说明
图1为香菇闵丰1号菌种SSR标记指纹图谱,其中M是50bp DNA ladder,数字代表的是所用的7对SSR引物,NC是空白对照,箭头所指的是香菇闵丰1号菌种的特异性SSR等位片段组合;
图2为引物Le_fp0001在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图3为引物Le_fp0002在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图4为引物Le_fp0003在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图5为引物Le_fp0004在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图6为引物Le_fp0005在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图7为引物Le_fp0006在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱;
图8为引物Le_fp0007在所选国审香菇栽培材料中的扩增图谱。
具体实施方式
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