[发明专利]一种构建大容量同义密码库及优化基因模板的方法无效
申请号: | 201210338706.X | 申请日: | 2012-09-13 |
公开(公告)号: | CN102864141A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 王明蓉;张雪梅;葛永红;何明跃 | 申请(专利权)人: | 成都生物制品研究所有限责任公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/13 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;全学荣 |
地址: | 610023 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 构建 容量 同义 密码 优化 基因 模板 方法 | ||
1.一种构建大容量同义密码库及优化基因模板的方法,其特征在于:它是通过优化模板基因核苷酸密码维持原目标蛋白的氨基酸序列不变,改进蛋白质的理化性质。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述理化性质为蛋白质可溶性、功能和/或稳定性。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:该方法包括如下步骤:
(a)构建同义密码基因库;
(b)表达步骤(a)同义密码基因库;
(c)筛选所需性质的目标蛋白;
(d)获得优化后的目的蛋白基因。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(a)所述的同义密码基因库是重组基因库。
5.根据权利要求3和4的方法,其特征在于:所述同义密码基因库包括指定位点上的同义密码库或全长基因同义密码库。
6.根据权利要求3-5任意一项所述的方法,其特征在于:同义密码基因库含有低、中或/和高使用频率的同义密码子。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(b)中,同义密码基因库通过蛋白表达系统产生蛋白;所述蛋白表达系统为原核,真核及无细胞表达系统。
8.根据权利要求3~7所述的方法,其特征在于:同义密码基因库所编码蛋白质可以是不同形式的蛋白,重组蛋白或多肽。
9.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(b)中,所述表达可以是分子伴侣共表达。
10.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(c)中,筛选鉴定所需性质的蛋白方法是高通量筛选,包括但不限于蛋白质展示或者其他富集方法。
11.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(c)中,所述筛选鉴定方法中可以使用报告基因,如GFP。
12.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:步骤(c)中,根据目标蛋白的可溶性、功能、产量和/或稳定性进行筛选。
13.根据权利要求12所述的方法,其特征在于:所述可溶性是指在蛋白表达或生理学缓冲液条件下保持可溶的状态。
14.根据权利要求12所述的方法,其特征在于:所述功能包括受体与配体结合、分子相互作用、底物特异性、抗原性和酶活性。
15.根据权利要求12所述的方法,其特征在于:所述稳定性包括高温稳定性、中温稳定性以及对低pH和/或高pH环境的稳定性。
16.SEQ ID NO.42~43所示的核苷酸序列。
17.根据权利要求1-12,该方法作为一个试剂盒。
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