[发明专利]检测IL28B(rs8099917)和ITPA(rs1127354)的突变的方法无效
申请号: | 201210353290.9 | 申请日: | 2012-09-14 |
公开(公告)号: | CN102994629A | 公开(公告)日: | 2013-03-27 |
发明(设计)人: | 黑濑薰;细见敏也 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 il28b rs8099917 itpa rs1127354 突变 方法 | ||
1.一种多态性检测用探针,其是用于检测IL28B基因的多态性的探针,其特征在于包含下述P1或P1’的荧光标记寡核苷酸,
(P1)寡核苷酸,其具有包含序列编号1所示的碱基序列中的第301~307位的碱基的碱基长为7~28的碱基序列或与之同源的序列,且与第307位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P1’)寡核苷酸,其具有在严格条件下与包含序列编号1所示的碱基序列中的第301~307位的碱基的碱基长为7~28的碱基序列的互补链杂交的序列,且与第307位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记。
2.一种多态性检测用探针,其是用于检测TIPA基因的多态性的探针,其特征在于包含选自下述P2~P3’中的至少一种的荧光标记寡核苷酸,
(P2)寡核苷酸,其具有与包含序列编号2所示的碱基序列中的第239~251位的碱基的碱基长为13~28的碱基序列互补的序列或与之同源的序列,且与第239位的碱基互补的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P2’)寡核苷酸,其具有在严格条件下与包含序列编号2所示的碱基序列中的第239~251位的碱基的碱基长为13~28的碱基序列杂交的序列,且与第239位的碱基互补的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P3)寡核苷酸,其具有包含序列编号2所示的碱基序列中的第251~256位的碱基的碱基长为6~42的碱基序列或与之同源的序列,且与第256位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P3’)寡核苷酸,其具有在严格条件下与包含序列编号2所示的碱基序列中的第251~256位的碱基的碱基长为6~42的碱基序列的互补链杂交的序列,且与第256位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记。
3.根据权利要求1或2所述的探针,其中,
P1和P1’的寡核苷酸在从3’末端起数第1位~第3位的位置具有经荧光染料标记的与第307位碱基对应的碱基,
P2和P2’的寡核苷酸在从3’末端起数第1位~第3位中的任何的位置具有经荧光染料标记的与第239位碱基互补的碱基,
P3和P3’的寡核苷酸在从3’末端起数第1位~第3位中的任何的位置具有经荧光染料标记的与第256位碱基对应的碱基。
4.根据权利要求1或2所述的探针,其中,
P1和P1’的寡核苷酸在3’末端具有经荧光染料标记的与第307位碱基对应的碱基,
P2和P2’的寡核苷酸在3’末端具有经荧光染料标记的与第239位碱基互补的碱基,
P3和P3’的寡核苷酸在3’末端具有经荧光染料标记的与第256位碱基对应的碱基。
5.根据权利要求1~4中任意一项所述的探针,所述荧光标记寡核苷酸在未与靶标序列杂交的时候发出荧光,并且与靶标序列杂交的时候荧光强度减少或增加。
6.根据权利要求5所述的探针,所述荧光标记寡核苷酸在未与靶标序列杂交的时候发出荧光,并且在与靶标序列杂交的时候荧光强度减少。
7.根据权利要求1~6中任意一项所述的探针,其中,
P1和P1’的寡核苷酸的碱基长为7~23,
P2和P2’的寡核苷酸的碱基长为13~23,
P3和P3’的寡核苷酸的碱基长为6~27。
8.根据权利要求1~6中任意一项所述的探针,其中,
P1和P1’的寡核苷酸的碱基长为7~18,
P2和P2’的寡核苷酸的碱基长为13~18,
P3和P3’的寡核苷酸的碱基长为6~22。
9.根据权利要求1~8中任意一项所述的探针,所述探针是用于熔解曲线分析的探针。
10.一种IL28B基因或ITPA基因中的多态性的检测方法,其特征在于使用权利要求1~9中任意一项所述的探针。
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