[发明专利]一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒及其引物和探针有效

专利信息
申请号: 201210360340.6 申请日: 2012-09-25
公开(公告)号: CN102965451A 公开(公告)日: 2013-03-13
发明(设计)人: 莫秋华;伍碧梅;赵俊华;杨泽;谭华;林继灿;杜田 申请(专利权)人: 珠海国际旅行卫生保健中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 广州市红荔专利代理有限公司 44214 代理人: 王贤义
地址: 519020 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 轮状病毒 实时 等温 扩增 检测 试剂盒 及其 引物 探针
【权利要求书】:

1.一种A组轮状病毒检测用引物,其特征在于,包括正向引物F1和反向引物R1,所述正向引物F1和所述反向引物R1的碱基序列表示如下:

正向引物F1:5’-AACATCATGCWACRGTWGGACT-3’;

反向引物R1: 

5’-AATTCTAATACGACTCACTATAGGGCAGATGGTTAGYYTGGTCCTYA-3’。

2.根据权利要求1所述的一种A组轮状病毒检测用引物,其特征在于:所述反向引物R1的5’端的25个碱基是增加的T7噬菌体启动子序列,而3’端22个碱基是与A组轮状病毒VP6基因靶RNA互补的特异性序列,所述正向引物F1和所述反向引物R1的3’端的病毒核酸变异位点使用简并碱基。

3.一条A组轮状病毒检测用分子信标探针,其特征在于,所述分子信标探针的碱基序列表示如下:

分子信标探针P1:

5’-FAM-CGATCGTATGCNRTACCRGTTGGACCCGATCG-DABCYL-3’,

所述分子信标探针P1在其寡核苷酸DNA分子的5’端标记荧光报告基团FAM,3’端标记荧光淬灭基团DABCYL。

4.根据权利要求3所述的一条A组轮状病毒检测用分子信标探针,其特征在于:所述分子信标探针P1的5’端和3’端的6个碱基是形成探针特征性发夹结构茎端区的反向互补序列,探针分子中间的20个碱基是与A组轮状病毒VP6基因互补的特异性序列,其中病毒核酸变异位点使用简并碱基。

5.一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒至少包括2×实时NASBA反应液和5×酶混合液,所述2×实时NASBA反应液包含有如权利要求1所述的正向引物F1和反向引物R1以及如权利要求3所述的分子信标探针P1。

6.根据权利要求5所述的一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于,所述2×实时NASBA反应液包括如下组分:

7.根据权利要求5所述的一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于,所述5×酶混合液包括如下组分:  

8.根据权利要求5所述的一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括阳性对照、阴性对照和空白对照。

9.根据权利要求8所述的一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述阳性对照为A组轮状病毒体外转录的VP6基因RNA片段。

10.根据权利要求8所述的一种A组轮状病毒实时等温扩增检测试剂盒,其特征在于:所述阴性对照为在核酸提取时与标本同时平行提取无菌生理盐水,所述空白对照为无核酸酶的超纯水。

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