[发明专利]空间铜绿假单胞菌LCT-PA41菌株

说明书

技术领域

本发明所涉及生物技术领域。具体地说，涉及一种空间环境下的新菌株--铜绿假单胞菌，生物学特性、全基因组学测序、转录组测序和差异蛋白组学分析。 

背景技术

铜绿假单胞菌是临床上常见的条件致病菌，长期应用激素、免疫抑制剂，进行肿瘤化疗、放射治疗等导致病人免疫功能低下，以及手术后或侵入性治疗操作后的病人易导致本菌感染，被认为是医院内感染的重要病原菌之一。其具备生存条件要求低，定植广泛，耐药水平高等特点，是临床微生物学研究热点菌种。 

随着我国“神舟”系列飞船、“天宫一号”、空间站等庞大的航天计划的实施，载人航天的医学保障需求日益突出，对空间生物医学的研究提出了更高的要求，同时也为空间生物医学研究提供了难得的实验平台。我们此次搭载“神舟八号”飞船，共搭载包括铜绿假单胞菌在内的64株细菌。该飞船在轨运行16天13小时(397小时)的时间，行程1100万公里。 

在国外针对空间领域铜绿假单胞菌的研究中，Guadarrama等发现模拟微重力环境下，微重力处理组铜绿假单胞菌PAl03菌株生长周期与对照组相比没有显著变化，外毒素产量无明显差异，但作者同时也指出，结果可能与培养基条件，微重力生物效应回转器回旋速度及回旋时间有关。而2008及2010年Crabbè等发表的研究结果表明，在模拟微重力条件下，铜绿假单胞菌藻酸盐、弹性蛋白酶、鼠李糖脂产生增加，但绿脓菌素的产量无明显差异。在真实太空环境下，铜绿假单胞菌缺乏类似报道。 

发明内容

本发明的目的在于：提供一种新的空间环境下的铜绿假单胞菌 LCT-PA41菌株，其保藏号为CGMCC NO.6522。上述提供菌株的各项生物学特性、差异表达基因和差异蛋白也是本发明的保护范围，其特征包括： 

1)菌株生物学特性 

革兰氏染色阴性，单个排列的无芽胞杆菌；相对于对照菌株，可见LCT-PA41菌株对氯霉素、头孢三嗪耐药性提高，而对阿奇霉素、美满霉素、美罗培南敏感性提高。不代谢糊精、右旋麦芽糖、右旋聚纤维二糖、β(1→6)葡二糖、松二糖、乳糖、车前二糖、3甲基-葡萄糖、左旋盐藻糖、N-乙酰-β-右旋葡糖胺酶、右旋甘露醇、阿(拉伯)糖醇、半乳糖、右旋6-磷酸葡萄糖、右旋丝氨酸，而代谢产物减少的包括α右旋葡萄糖、右旋甘露糖、右旋果糖、右旋盐藻糖、左旋盐藻糖、右旋半乳糖、甘油、6-磷酸果糖。 

2)生物信息学特性 

a).差异基因表达 

与对照菌株比较，差异表达基因(FDR≤0.001和|log2Ratio|≥2)，见附件1。 

b).蛋白组学 

同重同位素相对与绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation，iTRAQ)法进行样本蛋白定量分析。当蛋白质定量值的蛋白丰度差异倍数超过1.2倍以上，且经检验其p-value值小于0.05，视为单次重复间的差异蛋白，重复出现两次以上者被视为最终差异蛋白，符合条件差异蛋白见附件2。三次重复鉴定中达到要求差异蛋白如表1所示。 

表1三次重复鉴定的差异蛋白 

附图说明

图1LCT-PA41革兰氏染色 

图2生化谱实验板图2a LCT-PA41菌株，图2b地面对照菌株 

图3LCT-PA41的差异表达基因 

图4LCT-PA41的差异蛋白 

附件说明 

附件1空间铜绿假单胞菌LCT-PA41差异基因表达 

附件2空间铜绿假单胞菌LCT-PA41差异蛋白 

具体实施方式

下述实施实例中所用的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。 

下述实施实例中所用的材料、试剂，如无特殊说明，均可从商业途径获得。 

实施实例一：空间菌株搭载