[发明专利]1号染色体替换野生小家鼠品系C57BL/6.松江3‑Chr1的构建

说明书

技术领域

本发明属小鼠品系的构建领域，特别是涉及1号染色体替换野生小家鼠C57BL/6.松江3-Chr1的构建。

背景技术

实验小家鼠品系遗传多样性缺乏会对复杂性状研究造成较大的障碍，这主要表现在两个方面：首先，群体中各个基因座位的等位基因数量较少，在针对多基因相关性状的研究时，会由于基因背景的类同而导致部分性状相关基因信息的遗漏；其次，基因组连锁不平衡程度较大，这对性状相关基因的初步定位有利，但对精细定位造成很大的困难，导致耗费大量的时间和个体。

野生小家鼠生存环境复杂多样，且经历了漫长的进化，小鼠遗传多样性的表现就是表型性状丰富多样：(1)野生小家鼠群体中存在更丰富的性状差异，如野生小家鼠与实验小鼠相比对病原体感染的易感性具有明显差异。由于实验小鼠生存的环境使之躲避了病原体的侵袭，野生小家鼠则经历了选择，因此可以在野生小家鼠群体中找对特定病原体具有抗性的个体或群体，有些野生小家鼠群体本身就是某些病原体的天然宿主，这对研究人类病原体感染的免疫遗传学机制具有重大意义。(2)野生小家鼠丰富的遗传多样性也体现在基因相互作用上。例如将野生小家鼠与实验小鼠杂交可出现各种基因相互作用，在进化上分化几百万年的基因产物表达于同一个体中，不可避免会发生强烈的基因相互作用。

中国野生小家鼠大致分为两个亚种，即北方的musculus亚种及南方的castaneus亚种，松江位于上海，位于长江以南。通过DNA测序技术，对F1代小鼠1号染色体进行连锁不平衡分析得知，松江3(来源于上海松江)属于M.m.musculus和castaneus混合亚种，其野生小家鼠毛色为灰色，因为松江位于长江流域周边，处于中国的中间地带，南北方人员流动更为密切，因此松江3含有的M.m.musculus和castaneus亚种各占一半。

C57BL/6是第一个高质量的小鼠基因组序列草图是通过C57BL/6绘制的。其基因信息明确、生育力强，广泛应用于重大疾病的研究。鉴于C57BL/6小鼠基因信息明确，有必要以之作为背景，通过染色体替换试验，来研究松江3小鼠各染色体及其上的基因的功能。

目前对于松江3小鼠的研究较少，其遗传学特性较为不清楚。因此，克服技术难度以获得引进了松江3小鼠染色体的C57BL/6小鼠品系是研究的关键。

发明内容

本发明的目的在于提供1号染色体替换野生小家鼠品系C57BL/6.松江3-Chr1的构建。

在本发明的第一方面，提供一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6.松江3-Chr1的建立方法，所述方法包括：

(1)以松江3品系雄性小鼠作为父本、C57BL/6品系雌性小鼠作为母本进行杂交，获得F1代小鼠；

(2)将F1代雌性小鼠与C57BL/6品系雄性小鼠杂交，获得回交一代小鼠；该雄性回交小鼠中，Y染色体和线粒体DNA已被替换为C57BL/6品系来源的；使用多核苷酸多态性位点鉴定雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的回交小鼠；

(3)将选择到的雄性回交小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得下一代回交小鼠，该雄性回交小鼠中，X染色体已被替换为C57BL/6品系来源的；

(4)使用多核苷酸多态性位点鉴定雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；

(5)重复步骤(3)～(4)5-50次；从而获得染色体替代动物品系，其以C57BL/6品系小鼠为背景，且其1号染色体被松江3品系小鼠的1号染色体替换。

另一优选例中，所述的1号染色体的多核苷酸多态性位点包括：

rs31426703，其在1号染色体上所处位置为chr1：12720994；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T；

rs32086848，其在1号染色体上所处位置为chr1：17643006；在松江3品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A；