[发明专利]一种海参体表细菌DNA提取方法有效
申请号: | 201210439498.2 | 申请日: | 2012-11-06 |
公开(公告)号: | CN102911934A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 侯红漫;张公亮;高美玲;孙黎明;王璐 | 申请(专利权)人: | 大连工业大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 大连东方专利代理有限责任公司 21212 | 代理人: | 贾汉生;李馨 |
地址: | 116034 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 海参 体表 细菌 dna 提取 方法 | ||
1.一种海参体表细菌DNA的提取方法,其特征在于:包括以下步骤,
(1)海参样品处理:
取鲜活海参用无菌生理盐水冲洗三次,无菌封装后,迅速放置-80℃保存24h,取出海参在无菌条件下,用无菌刀片刨刮海参体表,将刨刮物放于无菌离心管中,50mL离心管装湿重6~10g的海参体表刨刮物;
(2)海参体表菌体收集:
①向步骤(1)获得的离心管中,加入15~20mL洗脱液Ⅰ,常温下300rpm震荡5~10min,使刨刮下的海参体表粘稠物与洗脱液Ⅰ充分混合;
②4℃下1000rpm离心5~8min,去除下层海参组织沉淀物及上层糊状物,将剩余液体转移到另一无菌离心管中;
③重复步骤②直至完全去除沉淀物和糊状物;
④将步骤③所得液体分装于1.5mL离心管,并于4℃10000rpm离心1~2min,收集沉淀,即为海参体表菌体沉淀物;
(3)粘多糖和杂蛋白的脱除:
于步骤④所得海参体表菌体沉淀物中,加入500uL裂解液,吹打至沉淀悬浮,然后55℃孵育震荡1~3h,直到悬浮液澄清,简短离心以去除管盖内壁水珠;
(4)细菌破壁
上述液体中加入180uL的浓度为20mg/mL溶菌酶,于37℃孵育酶解至少30min,期间间隔震荡直到产生的白色沉淀消失,简短离心以去除管盖内壁水珠;
(5)抽提、纯化:
⑤向步骤(4)获得的酶解液中加入300uL苯酚和300uL洗脱液Ⅱ,充分混匀后4℃12000rpm离心10~15min;
⑥吸取步骤⑤中上清液500uL,加入洗脱液Ⅱ500uL于1.5mLEppendorf管中,混匀后4℃12000rpm离心10min;
⑦吸取步骤⑥中上清液400uL,加入于-20℃预冷的无水乙醇,800uL于1.5mL Eppendorf管中,混匀后-20℃静置20min,4℃下12000rpm离心10min;
⑧白色沉淀用70%的乙醇洗涤2~3次,晾干后溶于100uL无菌超纯水中,轻轻震荡直至沉淀溶解,或放置于50uL缓冲液TE中,于-20℃条件下贮存。
2.根据权利要求1所述的一种海参体表细菌DNA的提取方法,其特征在于:所述试剂的配制方法如下:
洗脱液Ⅰ:磷酸二氢钾:0.27g,磷酸氢二钠:1.42g,氯化钠:8g,氯化钾:0.2g,加去离子水约700mL充分搅拌溶解,用盐酸调pH至7.4,最后定容到1L;然后加入200mL的CTAB溶液,高温高压灭菌后室温保存;
裂解液:3mL的CTAB溶液中,加入6uL的β-巯基乙醇和30uL的浓度为50mg/mL蛋白酶K;
CTAB溶液:100mmol/L Tris-Hcl,20mmol/L的EDTA,1.4mol/L的NaCl;
5×TE缓冲液:将Tris 54g,硼酸25g,0.5mol/L EDTA(pH8.0)20mL,加去离子水定容至1L后,混匀后放4℃保存;
洗脱液Ⅱ:异戊醇:氯仿的体积比为1:24。
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