[发明专利]一种用于检测对虾五种病毒的引物、液相芯片及其用途无效
申请号: | 201210439982.5 | 申请日: | 2012-11-06 |
公开(公告)号: | CN102912041A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 谢明星;彭小莉;刘棠;王群力;陈伟玲;王伟;陈双雅;刘荭;郑晓聪;王景明 | 申请(专利权)人: | 厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 厦门市诚得知识产权代理事务所(普通合伙) 35209 | 代理人: | 赖开慧 |
地址: | 361000 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 对虾 病毒 引物 芯片 及其 用途 | ||
1.一种液相芯片检测引物,其上游引物具有R1-R2-R3所表示的序列,,其中R1与液相芯片的微球连接序列反向互补,R3与待检测序列互补,R2为多聚dT,或寡聚四聚乙二醇,或(CH2)n间臂,n≥3;优选R2为(CH2)n间臂,n为12或18;更优选R2为(CH2)n间臂,n为18;下游引物标记生物素。
2.权利要求1所述的液相芯片检测引物,用于检测对虾一至五种病毒,其引物序列为以下至少一对:检测WSSV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:1,R3为SEQ ID NO:2,下游引物为SEQ ID NO:3,并5’端标记生物素;检测TSV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:4,R3为SEQ ID NO:5,下游引物为SEQ ID NO:6,并5’端标记生物素;检测YHV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:7,R3为SEQ ID NO:8,下游引物为SEQ ID NO:9,并5’端标记生物素;检测IHHNV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:10,R3为SEQ ID NO:11,下游引物为SEQ ID NO:12,并5’端标记生物素;检测IMNV的引物:上游引物中R1为SEQ ID NO:13,R3为SEQ ID NO:14,下游引物为SEQ ID NO:15,并5’端标记生物素。
3.一种用于检测对虾一至五种病毒的液相芯片,其特征是,包括:
1)权利要求2的引物;
2)偶联一定核苷酸序列的微球,所述序列选自SEQ ID NO:16-20,并能相应的与1)中引物序列互补配对。
4.一种用于检测对虾一至五种病毒的试剂盒,含有权利要求2的引物和权利要求3的液相芯片。
5.权利要求2的引物,权利要求3的液相芯片,权利要求4的试剂盒用于检测对虾一至五种病毒的用途。
6.权利要求2的引物,权利要求3的液相芯片,权利要求4的试剂盒用于检测对虾一至五种病毒的方法,其步骤为:
样品DNA或RNA提取;
PCR扩增;
与微球杂交;
仪器分析。
7.权利要求6的方法,其步骤为:所述样品DNA或RNA提取中,需要对DNA和RNA进行260nm和280nm的紫外光吸收率的测定,OD260值在0.05~1的区间内,且OD260/OD280比值在1.5~2.0之间。
8.权利要求6的方法,其特征在于:所述PCR扩增中,采用权利要求1所述的引物进行扩增;PCR的扩增体系如下:2×TaqMan Fast Universal PCR Master Mix 25μL;上下游引物分别浓度为0.3μmol/L~1.0μmol/L;从对虾中提取病毒RNA并合成的cDNA模板5μL或病毒DNA5μL;补水至50μL;反应条件为95℃变性10min;95℃45s,60℃退火45s,72℃延伸45s,循环40次;72℃3min。
9.权利要求6的方法,其特征在于:所述与微球杂交为,取1μL权利要求2的微球,加入22.5μL的1.1×杂交缓冲液,混匀;加入2.5μLPCR产物,95℃变性2min,然后42℃孵育30min;加入100μL的用1×杂交缓冲液稀释100倍的streptavidin-R-phycoerythrin,37℃孵育20min所述1.1×的杂交缓冲液为0.11M Tris-HCl,0.22MNaCl和0.088%TritonX-100;所述1×杂交缓冲液为0.1MTris-HCl,0.2MNaCl和0.08%TritonX-100。
10.权利要求4的方法,其特征在于,所述仪器分析为在LuminexTM200仪器上读取荧光中位数MF I值,根据读数进行结果判定;具体的,所述结果判定为:当样品的MFI值与空白样品的MFI值的比值≥3时结果判为阳性,如果其比值<2时判为阴性,如果2≤比值<3时结果判为可疑。
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