[发明专利]用于前列腺癌早期诊断的引物对、探针和试剂盒有效
申请号: | 201210442501.6 | 申请日: | 2012-11-08 |
公开(公告)号: | CN102912030A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
发明(设计)人: | 端鹏;叶欣;李博 | 申请(专利权)人: | 端鹏;叶欣;李博 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 210009 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 前列腺癌 早期 诊断 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种用于前列腺癌早期诊断的三组引物对,其特征在于:第一组引物对具有SEQ IDNO:1和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列;第二组引物对具有SEQ IDNO:2和SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;第三组引物对具有SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,所述三组引物对通过转录介导扩增技术来检测人体体内TMPRSS2:ERG、PCA3、PSA基因的表达水平,以判断前列腺癌发生的风险。
2.一种用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针,其特征在于:所述三个DNA探针分别具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列,且所述SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列上的*位置接有氨基酸自由基,所述氨基酸自由基上接有发光基团,所述SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的 3’端标记有生物素。
3.如权利要求2所述的用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针,其特征在于:所述发光基团为吖啶酯。
4.如权利要求3所述的用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针的制备方法,其特征在于:在3’端标记有生物素、且具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的DNA探针中*位置的氨基酸自由基上接上吖啶酯,具体步骤如下:
第一步,将吖啶酯溶于二甲基亚砜;
第二步,在水的参与下,所述溶于二甲基亚砜的吖啶酯与干燥的所述3’端标记有生物素、且具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的DNA探针在20~45 °C、pH6~9条件下反应20~60 min,再用赖氨酸中止反应;
第三步,在第二步的所述用赖氨酸中止反应后的溶液中加入醋酸钠和糖原,混匀所述醋酸钠和糖原后,于加入无水乙醇,并在0°C以下反应5 min~10 h,离心除去上清,保留沉淀物;
第四步,所述沉淀物用水溶解后,用反相高效液相色谱纯化。
5.一种前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有
容器a1,容器a1中装有具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列、用于检测TMPRSS2:ERG基因表达水平的启动子引物;
容器a2,容器a2中装有具有SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列、用于检测TMPRSS2:ERG基因表达水平的反向引物;
容器b1,容器b1中装有具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列、用于检测PCA3基因表达水平的启动子引物;
容器b2,容器b2中装有具有SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列、用于检测PCA3基因表达水平的反向引物;
容器c1,容器c1中装有具有SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列、用于检测PSA基因表达水平的启动子引物;
容器c2,容器c2中装有具有SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列、用于检测PSA基因表达水平的反向引物;
容器d,容器d中装有逆转录酶和RNA聚合酶的混合液;以及
固相载体,所述固相载体上涂有抗生蛋白链菌素,所述抗生蛋白链菌素上接有如权利要求2所述的DNA探针。
6.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述固相载体为96孔板。
7.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述抗生蛋白链菌素上接有如权利要求3所述的DNA探针。
8.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:
容器e,容器e中装有由已知拷贝数的TMPRSS2:ERG、PCA3或PSA的mRNA转录物组成的标准品;和
容器f,容器f中装有由已知拷贝数的TMPRSS2:ERG、PCA3或PSA的mRNA转录物组成的对比品。
9.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:
容器g,容器g中装有mRNA提取液。
10.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:
容器h,容器h中装有杂交液;
容器i,容器i中装有选择液;
容器j,容器j中装有显色液。
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