[发明专利]用于前列腺癌早期诊断的引物对、探针和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201210442501.6 申请日: 2012-11-08
公开(公告)号: CN102912030A 公开(公告)日: 2013-02-06
发明(设计)人: 端鹏;叶欣;李博 申请(专利权)人: 端鹏;叶欣;李博
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 南京知识律师事务所 32207 代理人: 汪旭东
地址: 210009 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 用于 前列腺癌 早期 诊断 引物 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用于前列腺癌早期诊断的三组引物对,其特征在于:第一组引物对具有SEQ IDNO:1和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列;第二组引物对具有SEQ IDNO:2和SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;第三组引物对具有SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,所述三组引物对通过转录介导扩增技术来检测人体体内TMPRSS2:ERG、PCA3、PSA基因的表达水平,以判断前列腺癌发生的风险。

2.一种用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针,其特征在于:所述三个DNA探针分别具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列,且所述SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列上的*位置接有氨基酸自由基,所述氨基酸自由基上接有发光基团,所述SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的 3’端标记有生物素。

3.如权利要求2所述的用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针,其特征在于:所述发光基团为吖啶酯。

4.如权利要求3所述的用于前列腺癌早期诊断的三个DNA探针的制备方法,其特征在于:在3’端标记有生物素、且具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的DNA探针中*位置的氨基酸自由基上接上吖啶酯,具体步骤如下:

第一步,将吖啶酯溶于二甲基亚砜;

第二步,在水的参与下,所述溶于二甲基亚砜的吖啶酯与干燥的所述3’端标记有生物素、且具有SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的DNA探针在20~45 °C、pH6~9条件下反应20~60 min,再用赖氨酸中止反应;

第三步,在第二步的所述用赖氨酸中止反应后的溶液中加入醋酸钠和糖原,混匀所述醋酸钠和糖原后,于加入无水乙醇,并在0°C以下反应5 min~10 h,离心除去上清,保留沉淀物;

第四步,所述沉淀物用水溶解后,用反相高效液相色谱纯化。

5.一种前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有

容器a1,容器a1中装有具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列、用于检测TMPRSS2:ERG基因表达水平的启动子引物;

容器a2,容器a2中装有具有SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列、用于检测TMPRSS2:ERG基因表达水平的反向引物; 

容器b1,容器b1中装有具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列、用于检测PCA3基因表达水平的启动子引物;

容器b2,容器b2中装有具有SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列、用于检测PCA3基因表达水平的反向引物;

容器c1,容器c1中装有具有SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列、用于检测PSA基因表达水平的启动子引物;

容器c2,容器c2中装有具有SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列、用于检测PSA基因表达水平的反向引物;

容器d,容器d中装有逆转录酶和RNA聚合酶的混合液;以及

固相载体,所述固相载体上涂有抗生蛋白链菌素,所述抗生蛋白链菌素上接有如权利要求2所述的DNA探针。

6.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述固相载体为96孔板。

7.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述抗生蛋白链菌素上接有如权利要求3所述的DNA探针。

8.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:

容器e,容器e中装有由已知拷贝数的TMPRSS2:ERG、PCA3或PSA的mRNA转录物组成的标准品;和

容器f,容器f中装有由已知拷贝数的TMPRSS2:ERG、PCA3或PSA的mRNA转录物组成的对比品。

9.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:

容器g,容器g中装有mRNA提取液。

10.如权利要求5所述的前列腺癌早期诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中还包括:

容器h,容器h中装有杂交液;

容器i,容器i中装有选择液;

容器j,容器j中装有显色液。

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