[发明专利]一种玉米油份含量相关基因的分子标记的应用有效
申请号: | 201210444716.1 | 申请日: | 2012-11-09 |
公开(公告)号: | CN102925457A | 公开(公告)日: | 2013-02-13 |
发明(设计)人: | 严建兵;杨小红;李建生;李慧 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12N15/11;C12Q1/68;A01H1/04 |
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地址: | 430070 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 玉米油 含量 相关 基因 分子 标记 应用 | ||
1.一种玉米油份含量相关的分子标记,其特征在于,所述的分子标记为玉米编码酰基载体蛋白(ACP)基因,该分子标记的具体位点位于玉米参考基因组(www.maizesequence.org,5a.60版)chr1.S_248149904的SNP,该位点突变为T/C,以及位于玉米ACP基因(GRMZM2G110298)3’UTR处的InDel_8位点。
2.如权利要求所述的分子标记的应用,其特征在于,该应用包括以下步骤:
a)由473个普通玉米自交系和35个高油玉米自交系组成AM508群体;
b)从授粉15天后的AM508份自交系中随机选择368份自交系,构建200bp大小插入片段文库,采用90bp末端配对的RNA测序技术进行转录组测序。
3.如权利要求1所述的玉米油份含量相关的分子标记的特异性扩增引物序列,其特征在于:所述ACP基因的InDel_8功能位点开发的PCR分子标记序列为:
5′-CGGGTGGAACTTGTTATGGC-3′
5′-AGGGCACTGAATCGGAACAC-3。
4.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的分子标记及其应用,其特征在于:玉米基因序列通过比对B73参考序列获得,利用Primer Premier5和P rimer3设计引物扩增全长,利用MUSCLE软件和BioEdit软件进行多序列处理和比对,利用TASSEL 2.0.1软件提取SNP和InDel,同时通过1000次排列检验计算多态性间的r2 值,采用F测验计算两个显著性信号位点间两两的连锁不平衡。
5.如权利要求1或2所述的玉米油份含量相关的分子标记在玉米育种的应用。
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