[发明专利]一种通用的CaMV 35S启动子定量检测方法无效
申请号: | 201210457032.5 | 申请日: | 2012-11-14 |
公开(公告)号: | CN102965435A | 公开(公告)日: | 2013-03-13 |
发明(设计)人: | 吴刚;李伟;李晓飞;张丽 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 黄瑞棠 |
地址: | 430062 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通用 camv 35 启动子 定量 检测 方法 | ||
1.一种通用CaMV 35S启动子定量检测方法,其特征在于:
①收集CaMV 35S启动子增强子保守区序列:
收集GMDD(GMO Detection Method Database,转基因检测方法数据库,http://gmdd.shgmo.org/)所公布的不同转化事件来源的CaMV 35S启动子序列,通过其序列比对结果,以其增强子序列的保守区为检测靶标,其序列特征是:
由来源于野生型CaMV 35S启动子第7018至7344个碱基组成,如图1所示:
②利用该序列特征设计引物探针:
a、合成引物序列如下:
35SEnhF187:5’CATCATTGCGATAAAGGAAAGGC 3’和35SEnhR311:5’TGCTTTGAAGACGTGGTTGGA 3’;
b、合成TaqMan探针序列如下:
35SEnhFP230:5’FAM-CCGACAGTGGTCCCAAAGATGG-BHQ13’;
③PCR扩增:
提取样品总DNA,分别利用上述引物35SEnhF187/35SEnhR311和探针35SEnhFP230组合进行荧光定量PCR扩增;
④建立标准曲线:
以含有CaMV 35S启动子的转基因油菜OXY235基因组DNA为研究模型,利用相同浓度非转基因油菜基因组DNA稀释至不同含量,以100ng的混和油菜基因组DNA为模板,进行荧光定量PCR反应并建立标准曲线;
⑤定量体系的精确性验证:
以标准曲线为参照测定含有OXY235基因组DNA的混和油菜基因组DNA样品中CaMV 35S启动子的量。
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