[发明专利]CDKN1A基因突变检测特异性引物和液相芯片有效
申请号: | 201210545834.1 | 申请日: | 2012-12-14 |
公开(公告)号: | CN103865986A | 公开(公告)日: | 2014-06-18 |
发明(设计)人: | 刘志明;林丽 | 申请(专利权)人: | 益善生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;秦雪梅 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cdkn1a 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种CDKN1A基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:
(A).针对CDKN1A基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对:每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对A7358T位点的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16,针对C98A位点的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18,针对G70A位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20,针对C258T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22,针对T3745C位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24,针对G2763A位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26,和/或针对C4008T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.14;
(B).有不同anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.29~SEQ ID NO.42,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的CDKN1A基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为:针对A7358T位点的SEQ ID NO.43及SEQ ID NO.44,针对C98A位点的SEQ ID NO.45及SEQ ID NO.46,针对G70A位点的SEQ ID NO.47及SEQ ID NO.48,针对C258T、C4008T位点的SEQ ID NO.49及SEQ ID NO.50,针对T3745C位点的SEQ ID NO.51及SEQ ID NO.52,和/或针对G2763A位点的SEQ ID NO.53及SEQ ID NO.54。
3.根据权利要求1所述的CDKN1A基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物为:针对A7358T位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.15组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.16组成的序列,针对C98A位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.17组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.18组成的序列,针对G70A位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.19组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.20组成的序列,针对C258T位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.21组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.22组成的序列,针对T3745C位点的由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.23组成的序列及由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.24组成的序列,针对G2763A位点的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.25组成的序列及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.26组成的序列,和/或针对C4008T位点的由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.27组成的序列及由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.28组成的序列。
4.根据权利要求1或2所述的CDKN1A基因突变检测液相芯片,其特征是,所述间隔臂为5-10个T。
5.用于CDKN1A基因突变检测的特异性引物,其特征是,特异性引物为针对A7358T位点的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16,针对C98A位点的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18,针对G70A位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20,针对C258T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22,针对T3745C位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24,针对G2763A位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26,和/或针对C4008T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28。
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