[发明专利]宏基因组提取方法有效
| 申请号： | 201210580611.9 | 申请日： | 2012-12-28 |
| 公开（公告）号： | CN103060309A | 公开（公告）日： | 2013-04-24 |
| 发明（设计）人： | 任鲁风;王绪敏;楚亚男;高静;谷岚;隋硕;康禹;徐力;袁丽娜;张奕杰;高占成;于军 | 申请（专利权）人： | 中国科学院北京基因组研究所;北京大学人民医院 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10 |
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| 地址： | 100029 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 宏基 提取 方法 | ||
1.一种宏基因组提取方法，其特征在于利用探针杂交磁珠捕获方式降低宿主宏基因组DNA样品中宿主DNA的影响。
2.根据权利要求1所述的宏基因组提取方法，其特征在于所述探针与所述宿主基因组DNA样品杂交后与所述磁珠偶联。
3.根据权利要求2所述的宏基因组提取方法，其特征在于包括步骤：
1）将标记有生物素的所述探针与提取的所述宿主宏基因组DNA样品进行杂交；
2）用包被有链霉亲和素的所述磁珠捕获探针与所述宿主DNA的复合体，并用磁力架分离磁珠-探针-目标DNA复合物；
3）将去除所述磁珠-探针-目标DNA复合物的杂交液以及杂交后的磁珠清洗液进行纯化回收DNA。
4.根据权利要求1所述的宏基因组提取方法，其特征在于所述探针与所述磁珠偶联后与所述宿主基因组的杂交。
5.根据权利要求4所述的宏基因组提取方法，其特征在于包括步骤：
1）利用包被有链霉亲和素的所述磁珠与标记生物素的所述探针偶联；
2）将偶联好的复合物与所述宿主宏基因组DNA样品杂交；
3）去除磁珠-探针-目标DNA复合物，对杂交液和杂交清洗液进行纯化回收DNA。
6.根据权利要求1~5的任一项所述的宏基因组提取方法，其特征在于在偶联温度下使用多种正反向探针。
7.根据权利要求3或5所述的宏基因组提取方法，其特征在于杂交完成之后，对所述磁珠-探针-DNA复合物进行加热或者氢氧化钠法变性，回收偶联有探针的磁珠。
8.根据权利要求1所述的宏基因组提取方法，其特征在于所述探针选自序列表中的序列SEQ ID NO：1至序列SEQ ID NO：139。
9.根据权利要求1所述的宏基因组提取方法，其特征在于所述宿主宏基因组DNA样品取自人呼吸道、口腔、消化道、皮肤或生殖道。
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