[发明专利]肝细胞癌的基因标签

权利要求书

1.分析肝细胞癌(HCC)患者的方法，其中所述方法包括：

(a)测定患者来源的肿瘤样品中3种或更多种基因的表达水平，其中所述3种或更多种基因选自：表1中所列的基因；表2A或表2B中所列的基因；表3中所列的基因；表4中所列的基因，表14中所列的基因，表15中所列的基因，和/或表16中所列的基因；以及

(b)将步骤(a)中测定的表达水平用于以下的一项或多项中：对患者进行分级或分类、提供预后、监测疾病进程、预测治疗干预的功效、挑选肿瘤治疗策略或评估治疗干预的功效。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述方法为将HCC患者分类为具有不良或良好预后的方法，包括以下步骤：

(a)测定患者来源的肿瘤样品中3种或更多种基因(优选5种或更多种基因)的表达水平，其中所述基因选自：表1中所列的基因；表2A或表2B中所列的基因；表3中所列的基因；表4中所列的基因，表14中所列的基因，表15中所列的基因，和/或表16中所列的基因；以及

(b)基于步骤(a)中测定的表达水平将患者分类为具有短或长的存活期，其中所述患者患有HCC。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述方法为评估治疗干预治疗HCC患者的功效的方法，包括以下步骤：

(a)测定患者来源的肿瘤样品中3种或更多种基因的表达水平，其中所述基因选自：表1中所列的基因；表2中所列的基因；表3中所列的基因；表4中所列的基因，表14中所列的基因，表15中所列的基因，和/或表16中所列的基因；和以及

(b)基于步骤(a)中测定的表达水平将患者分类为具有短或长的存活期，其中所述患者患有HCC，且其中步骤(b)的对患者的分类在治疗干预之前、期间和/或之后监测。

4.如权利要求1、2或3中任一项所述的方法，其中：

(i)表1的3种或更多种基因为表1中所列的至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(ii)表2A的3种或更多种基因是表2A中所列的至少3、4、5、6种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(iii)表2B的3种或更多种基因是表2B中所列的至少3、4、5、6种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(iv)表3的3种或更多种基因是表3中所列的至少3、4、5、6、7、8、9、10种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(v)表4的3种或更多种基因是表4中所列的至少3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(vi)表14的3种或更多种基因是表14中所列的至少3、4、5、6、7种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(vii)表15的3种或更多种基因是表15中所列的至少3、4种和/或所有的基因和/或以上的任意组合；

(viii)表16的3种或更多种基因是表16中所列的至少3、4种和/或所有的基因和/或以上的任意组合。

(ix)其中14种基因选自表1；

(x)表1的3种或更多种基因为来自表1的4至15种基因、4至14种基因、5至15种基因或5至14种基因；或

(xi)表1的3种或更多种基因包括：CCL2、CCL5和CCR2；CCL5、CCL2和CXCL10；或CCL5、CCL2、CXCL10和CCR2。

5.如权利要求1所述的方法，其中步骤(b)在对患者进行分级或分类、提供预后、监测疾病进程、预测治疗干预的功效、挑选肿瘤治疗策略或评估治疗干预的功效中使用其它的信息，且其中这类其它的信息任选地为分级信息和/或没有存在于表1、2A、2B、3、4、14、15或16中的一种或多种另外的标志物基因的表达(存在或缺失，或水平)，且其中所述一种或多种另外的标志物基因对HCC预后具有预测价值。

6.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中以下的一项或多项适用：(a)所述表达水平为标准化的表达水平和/或相对表达水平；(b)所述患者来源的肿瘤样品包含肿瘤浸润白细胞(TIL)、基质和肿瘤细胞；(c)所述患者为人。