[发明专利]用于降低核酸损伤的方法

权利要求书

1.在选自片段化和检测的核酸加工步骤期间抑制核酸降解的方法，其包括在所述加工步骤期间使所述核酸与包含没食子酸、其类似物、衍生物或混合物的溶液相接触，其中所述接触抑制所述核酸的降解。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸处于与支持物相连接的核酸阵列中。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述没食子酸、其类似物、衍生物或混合物以约10mM至约200mM的浓度存在。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法，其中所述溶液还包含一种或更多种化合物。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述化合物选自：尿素、抗坏血酸或其盐、以及异抗坏血酸或其盐。

6.根据权利要求4所述的方法，其中所述化合物进一步抑制所述核酸的降解。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述加工步骤是检测加工步骤。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述检测加工步骤包括照射所述核酸。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述照射在约360nm至约800nm的范围内进行。

10.根据权利要求8所述的方法，其中所述照射用功率为约5毫瓦至约500毫瓦的光源进行。

11.根据权利要求8所述的方法，其中所述照射进行约0.1秒至约10分钟的时间。

12.根据权利要求1所述的方法，其中所述降解是光诱导的降解。

13.根据权利要求12所述的方法，其中所述光诱导的降解包括从所述核酸阵列中除去核酸成员。

14.根据权利要求7所述的方法，其还包括向所述阵列添加荧光标记的核苷酸以及重复所述检测加工步骤。

15.根据权利要求14所述的方法，其中所述添加所述荧光标记的核苷酸包括使用聚合酶来添加单一的荧光标记的核苷酸。

16.根据权利要求14所述的方法，其还包括将所述检测加工和添加步骤重复至少50、75或100个循环。

17.根据权利要求7所述的方法，其中与对照相比，所述溶液将检测错误率降低大于20％、40％或50％。

18.根据权利要求1所述的方法，其中所述加工步骤是片段化。

19.根据权利要求18所述的方法，其中制备所述核酸以用于测序。

20.根据权利要求19所述的方法，其中与在不存在所述溶液的情况下片段化的核酸相比，所述核酸中序列信息的保真度提高。

21.根据权利要求18所述的方法，其还包括用切割包含受损核酸之核酸序列的酶处理所述核酸以除去任何受损核酸。

22.根据权利要求21所述的方法，其中所述酶是甲酰胺基嘧啶DNA糖基化酶(FPG)。

23.根据权利要求18所述的方法，其还包括用选择性地与一种或更多种类型之受损核酸相结合的抗体来处理样本以除去任何受损核酸。

24.根据权利要求23所述的方法，其中所述抗体与8一氧代-G结合。

25.用于降低核酸损伤的试剂盒，其包含一种或更多种化合物和(i)一种或更多种选择性地与一种或更多种类型之受损核酸相结合的抗体或者(ii)一种或更多种切割包含受损核酸之核酸序列的酶。

26.根据权利要求25所述的试剂盒，其中所述化合物选自：没食子酸或其衍生物或类似物、抗坏血酸或其衍生物或类似物、以及尿素。

27.根据权利要求26所述的试剂盒，其还包含一组说明书，所述说明书指导实施用于核酸样本制备之溶液的制备。