[发明专利]开发萜烯合酶变体的方法有效
申请号: | 201280011458.6 | 申请日: | 2012-02-01 |
公开(公告)号: | CN103608454A | 公开(公告)日: | 2014-02-26 |
发明(设计)人: | 赵立山;徐岚;P·韦斯特法尔;A·迈恩 | 申请(专利权)人: | 阿迈瑞斯公司 |
主分类号: | C12N9/88 | 分类号: | C12N9/88 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 罗菊华 |
地址: | 美国加*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 开发 萜烯合酶 变体 方法 | ||
1.一种试验萜烯合酶变体的提高的体内性能的方法,所述方法包括下述步骤:
(a)将宿主细胞群分成对照群和试验群;
(b)在所述对照群中表达对照萜烯合酶和对比萜烯合酶,其中所述对照萜烯合酶能够将聚异戊二烯基二磷酸转化成第一萜烯,且其中所述对比萜烯合酶能够将聚异戊二烯基二磷酸转化成第二萜烯;
(c)在所述试验群中表达试验萜烯合酶和所述对比萜烯合酶,其中所述试验萜烯合酶是所述对照萜烯合酶的变体,且其中所述对比萜烯合酶在所述试验群中和在所述对照群中以类似的水平表达;和
(d)在所述试验群中和在所述对照群中测量所述第一萜烯与所述第二萜烯之比。
2.根据权利要求1所述的方法,其中通过所述试验群中的所述第一萜烯与所述第二萜烯之比相对于所述对照群中的所述第一萜烯与所述第二萜烯之比的增加,将所述试验群鉴别为包含萜烯合酶变体,所述萜烯合酶变体具有比所述对照萜烯合酶提高的体内性能。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述对照萜烯合酶、对比萜烯合酶和所述试验萜烯合酶是倍半萜合酶,且所述聚异戊二烯基二磷酸是法呢基二磷酸(FPP)。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述对比萜烯合酶是曲古二烯合酶。
5.根据权利要求3所述的方法,其中所述对照萜烯合酶和试验萜烯合酶是具有金合欢烯合酶活性的合酶。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述对照萜烯合酶、对比萜烯合酶和所述试验萜烯合酶是单萜合酶,且所述聚异戊二烯基二磷酸是香叶基二磷酸(GPP)。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述宿主细胞包含MEV途径的一种或多种异源酶。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述MEV途径的一种或多种异源酶选自:ERG8、ERG10、ERG12、ERG13、ERG19和HMG1。
9.根据权利要求1所述的方法,其中所述试验萜烯合酶与所述对照萜烯合酶相差1-10个氨基酸。
10.根据权利要求2所述的方法,其中所述第一萜烯与所述第二萜烯之比是至少1.3。
11.根据权利要求1所述的方法,其中试验萜烯合酶在所述试验群中的表达水平与所述对照萜烯合酶在所述对照群中的表达水平类似。
12.根据权利要求1所述的方法,其中所述对照萜烯合酶和所述试验萜烯合酶是相同的,但是在所述对照群和所述试验群中以不同的水平表达。
13.根据权利要求1所述的方法,其中所述宿主细胞群是酵母细胞群。
14.一种包含2个细胞亚群的组合物,所述2个细胞亚群源自共同的宿主细胞群,其中:
(a)所述第一亚群包含对照萜烯合酶和对比萜烯合酶,其中所述对照萜烯合酶将聚异戊二烯基二磷酸转化成第一萜烯,且其中对比倍半萜合酶将聚异戊二烯基二磷酸转化成第二萜烯;
(b)所述第二亚群包含试验萜烯合酶和所述对比萜烯合酶,其中所述对照萜烯合酶将聚异戊二烯基二磷酸转化成所述第一萜烯,且其中所述试验萜烯合酶是所述对照萜烯合酶的变体。
15.根据权利要求14所述的组合物,其中在所述第二亚群中的所述第一萜烯与所述第二萜烯之比大于在所述第一亚群中的所述第一萜烯与所述第二萜烯之比。
16.一种鉴别具有提高的体内性能的倍半萜合酶变体的方法,所述方法包括下述步骤:
(a)将表达对照倍半萜合酶的宿主细胞工程改造成包含高水平的FPP,其中与不包含所述高水平的FPP的亲本细胞相比,所述高水平的FPP降低所述宿主细胞的生存力;
(b)在所述宿主细胞中表达试验倍半萜合酶而不是对照倍半萜合酶,其中所述试验倍半萜合酶是所述对照倍半萜合酶的变体;和
(c)通过与表达所述对照倍半萜合酶的宿主细胞相比表达所述试验倍半萜合酶的宿主细胞的生存力增加,将所述试验倍半萜合酶鉴别为具有与所述对照倍半萜合酶相比提高的体内性能。
17.根据权利要求16所述的方法,其中步骤(a)至(c)在至少2个循环中进行,其中每个循环包括步骤(a)至(c),且其中在第一个循环以后的每个循环的步骤(a)中,所述对照倍半萜合酶是在前一个循环中鉴别出的具有提高的体内性能的倍半萜合酶变体。
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