[发明专利]用于移植结肠微生物群的组合物和方法

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求了2011年3月9日提交的美国临时申请序列号61/450,838的权益，该美国临时申请通过引用结合在此。

政府资助

本发明是在政府支持下根据美国国家卫生研究院（NIH）授予的拨款号R21AI091907进行的。政府拥有本发明的某些权利。

背景

1978年，艰难梭菌首先被确认为与使用抗微生物剂有关的腹泻和伪膜性结肠炎的主要病因。从这时起，北美和欧洲的艰难梭菌感染的发生率、发病率以及死亡率不断增长（弗里曼（Freeman）等人，临床微生物学评论（Clin Microbiol Rev）2010;23:529-49；凯莉（Kelly）和拉蒙特（LaMont），新英格兰医学杂志（N Engl J Med）2008;359:1932-40）。1996年到2003年间美国国家出院调查（U.S.National Hospital Discharge Survey）统计的分析揭示在住院患者中诊断为艰难梭菌感染（CDI）的患病率加倍到0.61/1,000（麦克唐纳（McDonald）等人，新发感染性疾病（Emerg Infect Dis）2006;12:409-15）。一项2008年关于所有美国急性病护理设施的12.5%的调查表明CDI患病率为13.1/1,000，这比以前发现的高至少一个数量级（贾维斯（Jarvis）等人，美国感染控制杂志（Am J Infect Control）2009;37:263-70）。虽然老年患者与年轻个体相比具有不成比例地更大比率的CDI，但并无年龄组被省去，并且甚至在儿科群体中CDI相关住院的发生率也已正在上升（茨尔柏柏格（Zilberberg）等人，新发感染性疾病2010;16:604-9）。发生率增加已因这种疾病的最重度形式的频率升高而进一步复杂化，如通过上升的CDI相关发病率和病死率所证明（里恰尔迪（Ricciardi）等人，外科学文献（Arch Surg）2007;142:624-31；讨论631；茨尔柏柏格等人，新发感染性疾病2008;14:929-31）。这在某种程度上与毒性更强的艰难梭菌菌株的出现有关，如PCR核糖核酸型027/北美脉冲场型1（NAP1），其特征为与其他临床上相关情况相比更大的产毒素潜能和抗生素抗性（鲁尼克（Rupnik）等人，自然评论：微生物学（Nat Rev Microbiol）2009;7:526-36；库伊普尔（Kuijper）等人，欧洲监测（Euro Surveill）2008;13）。

复发性CDI是最困难并且越来越常见的与CDI有关的挑战之一（苏拉威茨（Surawicz），胃肠病学（Gastroenterology）2009;136:1152-4）。在约20%-30%的病例中，初始发生的CDI随后可能在30天内复发（凯莉和拉蒙特，新英格兰医学杂志2008;359:1932-40；路易（Louie）等人，新英格兰医学杂志2011;364:422-31；佩平（Pepin）等人，临床感染性疾病（Clin Infect Dis）2006;42:758-64），并且在发生两次或更多次之后复发的风险加倍（麦克唐纳等人，新发感染性疾病2006;12:409-15）。更老的年龄、针对非艰难梭菌适应症的介入性抗生素使用、肾功能不全、免疫缺乏以及抗酸药物是关于复发性CDI的一些已知风险因素（苏拉威茨，胃肠病学2009;136:1152-4；加里（Garey）等人，医院感染杂志（J Hosp Infect）2008;70:298-304）。仅三种临床标准：年龄>65岁、重度疾病以及治疗初始CDI事件之后继续使用抗生素的存在预示了几乎90%的复发率（胡（Hu）等人，胃肠病学2009;136:1206-14）。CDI通常还使发炎性肠道疾病（IBD）的处理变复杂，这近来已被确认为CDI感染的一种额外的独立风险因素（伊萨（Issa）等人，临床肠胃病学与肝脏病学（Clin Gastroenterol Hepatol）2007;5:345-51；罗德曼（Rodemann）等人，临床肠胃病学与肝脏病学2007;5:339-4415）。潜在IBD患者中的CDI与增加的结肠炎严重性和更高的复发率以及结肠切除术有关（伊萨等人，发炎性肠道疾病（Inflamm Bowel Dis）2008;14:1432-42）。