[发明专利]用于检测萨宾口服脊髓灰质炎病毒疫苗病毒的基因组中的核苷酸置换的试验有效
申请号: | 201280023280.7 | 申请日: | 2012-03-07 |
公开(公告)号: | CN103717756A | 公开(公告)日: | 2014-04-09 |
发明(设计)人: | J·M·达什潘德;S·S·南迪;D·K·沙玛 | 申请(专利权)人: | 印度医学研究理事会 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 李瑛 |
地址: | 印度*** | 国省代码: | 印度;IN |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 口服 脊髓灰质炎病毒 疫苗 病毒 基因组 中的 核苷酸 置换 试验 | ||
1.用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试验,其包括以下步骤:
a.从各种来源获得脊髓灰质炎病毒样品,
b.通过使用反义PCR引物合成cDNA,产生步骤a的脊髓灰质炎病毒的DNA扩增子,
c.纯化步骤b的DNA扩增子,
d.使用SEQ ID I-II的PCR引物,进行多重单核苷酸多态性检测试验,
e.通过电泳解析SNP,
f.检索数据,并使用Gene Mapper软件分析这些数据。
2.如权利要求1中所要求的用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试验,其中所述病毒选自1-型脊髓灰质炎病毒(萨宾病毒)、2-型脊髓灰质炎病毒和3-型脊髓灰质炎病毒。
3.如权利要求1中所要求的用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点突变的或SNP的试验,其中所述引物序列ID1至6检测1-型脊髓灰质炎病毒(萨宾病毒)中的SNP,引物序列ID7至9检测2-型脊髓灰质炎病毒中的SNP,引物序列ID10至II用于检测3-型脊髓灰质炎病毒中的SWP。
4.如权利要求1中所要求的用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试验,其中所述引物检测三种血清型的活减毒口服脊髓灰质炎病毒疫苗(萨宾)病毒、疫苗样和疫苗衍生的脊髓灰质炎病毒中的SNP。
5.如权利要求1中所要求的用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试验,其中所述引物在其长度上具有变化。
6.如权利要求5中所要求的用于同时检测三种血清型的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试验,其中引物中的变化是比待研究的减毒位点短一个核苷酸。
7.如之前所述权利要求任一项中要求的试验,其中所述引物已经设计成结合可变长度的5’端尾。
8.如之前所述权利要求任一项中要求的试验,其中以递增的长度设计引物,使得当在Genetic Analyzer中解析时,以递升次序首先表示第一个减毒位点,而最后一个位点在最后。
9.如权利要求1中所要求的试验,其中如果要包括新的位点,则可以将附加引物并入一个多重试验中。
10.用于检测所有三种血清型的活减毒口服脊髓灰质炎病毒疫苗(萨宾)病毒、疫苗样和疫苗衍生的脊髓灰质炎病毒的基因组中的特定位点的突变或SNP的试剂盒,其中该试剂盒包含所述序列ID I至II的引物。
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