[发明专利]产石房蛤毒素的鞭毛藻的检测有效
申请号: | 201280023720.9 | 申请日: | 2012-05-16 |
公开(公告)号: | CN103748235A | 公开(公告)日: | 2014-04-23 |
发明(设计)人: | 布雷特·A·尼兰;肖纳·安·默里;安可·斯图克恩;谢蒂尔·S·雅各布森;拉塞尔·J·S·奥尔;拉尔夫·凯尔曼 | 申请(专利权)人: | 新南创新有限公司;奥斯陆大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/25;C12N9/00;C12N15/52 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 澳大利亚新*** | 国省代码: | 澳大利亚;AU |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 产石房蛤 毒素 鞭毛藻 检测 | ||
1.一种用于检测样品中的产石房蛤毒素的鞭毛藻的方法,该方法包括:
获得用于该方法的一种样品,并且
分析该样品中鞭毛藻石房蛤毒素A聚核苷酸或由所述聚核苷酸编码的多肽中的一种或多种的存在,
其中所述聚核苷酸或多肽的存在指示该样品中的产石房蛤毒素的鞭毛藻的存在。
2.一种用于确定样品中产石房蛤毒素的鞭毛藻不存在的方法,该方法包括:
获得用于该方法的一种样品,并且
分析该样品中鞭毛藻石房蛤毒素A聚核苷酸或由所述聚核苷酸编码的多肽中的一种或多种的存在,
其中所述聚核苷酸或多肽的不存在指示该样品中的产石房蛤毒素的鞭毛藻的不存在。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中该聚核苷酸包含石房蛤毒素A核苷酸序列,该石房蛤毒素A核苷酸序列选自以SEQ ID NO:5-197、224-227、230-242以及247中的任一种所示的那些序列或那些序列中的任一种的片段或变异体。
4.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中该聚核苷酸包含石房蛤毒素A1催化域序列、石房蛤毒素A4催化域序列或其片段。
5.根据权利要求4所述的方法,其中该石房蛤毒素A4催化域序列或其片段包含以SEQ ID NO:3所示的聚核苷酸序列的核苷酸3115-4121、以SEQ ID NO:3所示的聚核苷酸序列的核苷酸3597-3721或二者之一的序列的片段或变异体。
6.根据权利要求4所述的方法,其中该石房蛤毒素A1催化域序列包含以SEQ ID NO:1所示的聚核苷酸序列的核苷酸160-1821、以SEQ ID NO:3所示的聚核苷酸序列的核苷酸277-2022或二者之一的序列的片段或变异体。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述分析包括通过聚合酶链式反应来扩增来自该样品的聚核苷酸。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述聚合酶链式反应利用一种或多种引物,该一种或多种引物包含以SEQ ID NO:198-199、200-211、220-223、228-229以及243-244中的任一种所示的序列或那些序列中的任一种的片段或变异体。
9.根据权利要求1或权利要求2所述的方法,其中该多肽包含以SEQID NO:2或SEQ ID NO:4所示的石房蛤毒素A氨基酸序列或二者之一的序列的片段或变异体。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其中该产石房蛤毒素的鞭毛藻是来自亚历山大藻(Alexandrium)、盾甲藻(Pyrodinium)或裸甲藻(Gymnodinium)属。
11.根据权利要求10所述的方法,其中该产石房蛤毒素的鞭毛藻是选自下组,该组由以下各项组成:链状亚历山大藻(A.catenella)、芬迪湾亚历山大藻(A.fundyense)、无菌亚历山大藻(A lusitanicum)、微小亚历山大藻(A.minutum)、当乌氏亚历山大藻(A.ostenfeldii)、塔玛亚历山大藻(A.tamarense)、链状裸甲藻(G.catenatum)以及巴哈马麦甲藻扁平变种(P.bahamense var compressum)。
12.一种用于检测样品中的产石房蛤毒素的鞭毛藻的试剂盒,该试剂盒包含至少一种用于检测鞭毛藻石房蛤毒素A聚核苷酸或由所述聚核苷酸编码的多肽的存在的试剂。
13.一种用于确定样品中的产石房蛤毒素的鞭毛藻的不存在的试剂盒,该试剂盒包含至少一种用于检测鞭毛藻石房蛤毒素A聚核苷酸或由所述聚核苷酸编码的多肽的存在的试剂。
14.根据权利要求12或权利要求13所述的试剂盒,其中该试剂特异性地结合到包含石房蛤毒素A核苷酸序列的聚核苷酸上,该石房蛤毒素A核苷酸序列选自以SEQ ID NO:5-197、224-227、230-242以及247中的任一种所示的那些序列或那些序列中的任一种的片段或变异体。
15.根据权利要求12或权利要求13所述的试剂盒,其中该试剂特异性地结合到包含石房蛤毒素A1催化域序列、石房蛤毒素A4催化域序列或其片段的聚核苷酸上。
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