[发明专利]用于肺癌分类的方法在审
申请号: | 201280026211.1 | 申请日: | 2012-03-26 |
公开(公告)号: | CN103764844A | 公开(公告)日: | 2014-04-30 |
发明(设计)人: | G.里斯维克亚奈;H.本贾明 | 申请(专利权)人: | 罗塞塔金诺米克斯有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 孔青;梁谋 |
地址: | 以色列*** | 国省代码: | 以色列;IL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 肺癌 分类 方法 | ||
1. 一种用于区分肺癌的特定亚型的方法,所述方法包括:自受试者获得生物样品;测定所述样品中的选自SEQ ID NO: 1-8、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列的核酸序列的表达谱;并将所述表达谱与参比表达谱进行比较;其中所述表达谱与所述参比表达谱的比较结果表明所述肺癌。
2. 权利要求1的方法,其中所述肺癌选自鳞状细胞癌、非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)、肺类癌和小细胞肺癌。
3. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 3、7、8;其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,且其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有肺类癌。
4. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 1、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有小细胞肺癌(SCLC)。
5. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 2、5、6;其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)。
6. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 4、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有鳞状细胞癌。
7. 权利要求1的方法,其中所述生物样品选自体液、细胞系和组织样品。
8. 权利要求7的方法,其中所述组织是新鲜的、冷冻的、固定的、蜡包埋的或福尔马林固定石蜡包埋的(FFPE)组织。
9. 权利要求7的方法,其中所述组织样品是肺肿瘤样品。
10. 权利要求1的方法,其中所述方法包括测定至少两个核酸序列的表达谱。
11. 权利要求10的方法,其中所述方法还包括组合所述核酸序列的一个或多个表达比。
12. 权利要求1的方法,其中所述表达谱通过选自核酸杂交、核酸扩增及其组合的方法测定。
13. 权利要求12的方法,其中所述核酸杂交使用固相核酸生物芯片阵列或原位杂交进行。
14. 权利要求12的方法,其中所述核酸扩增方法是实时PCR。
15. 权利要求14的方法,其中所述实时PCR方法包括正向和反向引物。
16. 权利要求15的方法,其中所述正向引物包含选自以下的序列:SEQ ID NO: 9-16的任一个和与之有至少约80%同一性的序列。
17. 权利要求16的方法,其中所述实时PCR方法还包括探针。
18. 权利要求17的方法,其中所述探针包含选自SEQ ID NO: 17-24的任一个的序列。
19. 一种用于肺癌分类的试剂盒,所述试剂盒包含探针,所述探针包含与选自SEQ ID NO: 1-8、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列的序列互补的核酸序列。
20. 权利要求19的试剂盒,其中所述探针包含选自SEQ ID NO: 17-24和与之具有至少约80%同一性的序列的核酸序列。
21. 权利要求20的试剂盒,其中所述试剂盒还包含正向引物,所述正向引物包含选自SEQ ID NO: 9-16的任一个和与之具有至少约80%同一性的序列的序列。
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