[发明专利]用于肺癌分类的方法在审

专利信息
申请号: 201280026211.1 申请日: 2012-03-26
公开(公告)号: CN103764844A 公开(公告)日: 2014-04-30
发明(设计)人: G.里斯维克亚奈;H.本贾明 申请(专利权)人: 罗塞塔金诺米克斯有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 孔青;梁谋
地址: 以色列*** 国省代码: 以色列;IL
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摘要:
搜索关键词: 用于 肺癌 分类 方法
【权利要求书】:

1. 一种用于区分肺癌的特定亚型的方法,所述方法包括:自受试者获得生物样品;测定所述样品中的选自SEQ ID NO: 1-8、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列的核酸序列的表达谱;并将所述表达谱与参比表达谱进行比较;其中所述表达谱与所述参比表达谱的比较结果表明所述肺癌。

2. 权利要求1的方法,其中所述肺癌选自鳞状细胞癌、非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)、肺类癌和小细胞肺癌。

3. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 3、7、8;其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,且其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有肺类癌。

4. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 1、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有小细胞肺癌(SCLC)。

5. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 2、5、6;其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)。

6. 权利要求1的方法,其中所述核酸序列选自SEQ ID NO: 4、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列,其中与所述参比表达谱相比,所述核酸序列相对高的表达水平表明有鳞状细胞癌。

7. 权利要求1的方法,其中所述生物样品选自体液、细胞系和组织样品。

8. 权利要求7的方法,其中所述组织是新鲜的、冷冻的、固定的、蜡包埋的或福尔马林固定石蜡包埋的(FFPE)组织。

9. 权利要求7的方法,其中所述组织样品是肺肿瘤样品。

10. 权利要求1的方法,其中所述方法包括测定至少两个核酸序列的表达谱。

11. 权利要求10的方法,其中所述方法还包括组合所述核酸序列的一个或多个表达比。

12. 权利要求1的方法,其中所述表达谱通过选自核酸杂交、核酸扩增及其组合的方法测定。

13. 权利要求12的方法,其中所述核酸杂交使用固相核酸生物芯片阵列或原位杂交进行。

14. 权利要求12的方法,其中所述核酸扩增方法是实时PCR。

15. 权利要求14的方法,其中所述实时PCR方法包括正向和反向引物。

16. 权利要求15的方法,其中所述正向引物包含选自以下的序列:SEQ ID NO: 9-16的任一个和与之有至少约80%同一性的序列。

17. 权利要求16的方法,其中所述实时PCR方法还包括探针。

18. 权利要求17的方法,其中所述探针包含选自SEQ ID NO: 17-24的任一个的序列。

19. 一种用于肺癌分类的试剂盒,所述试剂盒包含探针,所述探针包含与选自SEQ ID NO: 1-8、其片段和与之具有至少约80%同一性的序列的序列互补的核酸序列。

20. 权利要求19的试剂盒,其中所述探针包含选自SEQ ID NO: 17-24和与之具有至少约80%同一性的序列的核酸序列。

21. 权利要求20的试剂盒,其中所述试剂盒还包含正向引物,所述正向引物包含选自SEQ ID NO: 9-16的任一个和与之具有至少约80%同一性的序列的序列。

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