[发明专利]细胞组学血管健康概况分析的系统和方法

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求2011年6月10提交的美国临时申请序列号61/495,955和2012年5月22日提交的美国临时申请序列号61/650,353的优先权权益，其全部公开内容通过引用被并入本文，如同每个以其全部在本文中列出。

发明背景

心血管疾病(CVD)在美国是最主要的死亡原因；每39秒一个成人死于心脏病发作、中风或其它心血管疾病(“在美国，高血压和胆固醇失去控制”。疾病控制中心网站。http://www.cdc.gov/Features/Vitalsigns/CardiovascularDisease/。2011年1月31日更新，2012年2月6日访问)。美国CVD患病率已经非常高(36.9%的成人或约8千1百万人)并预测在接下来的20年里增加约10%，到2030年估计超过40%的成人(大约1亿1千6百万人)将患有一种或多种形式的CVD(Heidenreich et al.,2011,Circulation123:933-944)。很早以前症状在临床上是明显的，新生血管疾病开始于内皮细胞机能异常。当动脉粥样硬化进展到阻塞的血流引起缺血的点时，或当由于破裂或侵蚀，血栓从存在的斑块形成时，有症状的、临床CVD事件通常发生(Heidenreich et al.,2011,Circulation123:933-944)。

令人遗憾地，目前不存在有成本效益的和准确的可确定患者心血管健康的血液测试。相反，心血管风险通常由若干循环生物标记，如高灵敏度C-反应蛋白(hsCRP)和纤维蛋白原进行评估(Ridker,2003,Circulation107:363-369)。由于这些生物标记通常是急性期反应物，因此对于动脉粥样硬化不是特异性的，它们只被推荐给具有心血管事件的中等风险的患者(Greenland et al.,2010,Circulation122:e584-e636)。同样，在临床实践中没有可用的生物标记来灵敏地和准确地评价对医学治疗的反应。心血管风险分层的基于弗雷明汉（Framingham）的方法没有结合生物标记或遗传异常，因此预测值受限。

一个公开的心血管风险算法，雷诺尔德（Reynolds）评分，包括hsCRP，但是，如同弗雷明汉，遗传背景不包括在方案中。实践和预防工作组中基因组应用的评价（Evaluation of Genomic Applications in Practice and Prevention Working Group(EWG)）发现推荐测试28个基因中219p21遗传变体或57个其它变体以在一般人群中评估CVD特别是心脏病和中风风险的证据不充分。EWG提出来自单独或组合使用这些基因组标记中任何一个的净健康益处的量是可以忽略的(Evaluation ofGenomic Applications in Practice Prevention Working Group.2010.Recommendations from the EGAPP Working Group:Genomic profiling to assess cardiovascular risk to improve cardiovascular health.Journal12:839-843810.1097/GIM.1090b1013e3181f1872c1090)。

因此，存在对早期诊断测试未满足的临床需要，该早期诊断测试提供在明显的CVD之前心血管健康的测量和治疗干预的评估。本发明通过细胞基试验满足该需要，该细胞基试验基于血管健康概况（Vascular Health Profile）(VHP)的建立中祖细胞(PCs)，如内皮祖细胞(EPCs)和微粒(MPs)的测量而评估心血管状态。

发明概述

本发明涉及确定对象中的血管健康的方法。该方法包括以下步骤：从对象获得生物样品；基于生物样品中至少一组微粒的水平获得微粒数据；基于生物样品中至少一组祖细胞的水平获得祖细胞数据；基于微粒和祖细胞数据产生生物样品的流式细胞术指纹（cytometric fingerprint）；和基于产生的流式细胞术指纹确定对象的血管健康。