[发明专利]用于高通量识别新型杀虫组合物的整合的方法及其用途

权利要求书

1.一种识别编码生物毒素的核酸序列的方法，所述方法包括：

生成来自多种微生物分离株的染色体外DNA分子的混合群体；

建立宏基因组序列数据集，所述宏基因组序列数据集包括来源于所述染色体外DNA分子的混合群体的核酸序列；

处理所述宏基因组序列数据集的序列数据以定义至少一个核酸序列重叠群；以及

通过比较步骤(c)的所述至少一个核酸序列重叠群与已知生物毒素序列来识别编码生物毒素的核酸序列。

2.根据权利要求1所述的方法，所述方法进一步包括测定所述微生物分离株的系统分类的步骤。

3.根据权利要求1所述的方法，其中预选所述多种微生物分离株产生至少一种生物毒素的能力。

4.根据权利要求1所述的方法，所述方法进一步包括测定由所述步骤(d)识别的所述核酸序列是否编码新型生物毒素的步骤，其中经识别的所述新型毒素的核酸序列与任何已知生物毒素序列具有小于30%序列同一性。

5.权利要求1所述的方法，其中所述多种微生物分离株包含至少12种微生物分离株。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述微生物分离株的至少一种为细菌。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述细菌具有选自以下的种属：芽孢杆菌属、短芽孢杆菌属、梭菌属、类芽孢杆菌属、光杆状菌属、假单胞菌属、沙雷氏菌属、链霉菌属、和致病杆菌属。

8.根据权利要求1所述的方法，其中通过排除分子克隆的直接测序工序来生成所述宏基因组序列数据集。

9.一种分离的核酸分子，其包含通过权利要求1-8中任一项所述的方法识别的核酸序列。

10.一种分离的核酸分子，其包含：

在高严格性的条件下与在序列表中任意一个核苷酸序列杂交的核酸序列、其补体或它们任一者的片段；或者

表现出与在序列表中任意一个氨基酸序列的70%或更大序列同一性的核酸序列、其补体或它们任一者的片段；或者

编码表现出与在序列表中任意一个氨基酸序列的50%或更大序列同一性的氨基酸序列的核酸序列。

11.一种包含根据权利要求10所述的核酸分子的核酸构建体，其中所述核酸分子可操作连接异源性核酸。

12.一种包含根据权利要求11所述的核酸构建体的宿主细胞。

13.根据权利要求12所述的宿主细胞，其中所述宿主细胞是植物细胞或微生物细胞。

14.一种包含根据权利要求12所述的宿主细胞的宿主有机体。

15.一种来源于根据权利要求14所述的宿主有机体的生物样品或子代。

16.一种赋予有机体杀虫活性的方法，所述方法包括引入根据权利要求10所述的核酸分子至所述有机体，其中将所述核酸分子转录，从而导致如与对照有机体相比，所述有机体对害虫的抵抗性增加。

17.一种分离的多肽，其中所述多肽通过核酸分子来编码，所述核酸分子包含：

在高严格性的条件下与在序列表中任意一个核苷酸序列杂交的核酸序列、其补体或它们任一者的片段；或者

表现出与在序列表中任意一个氨基酸序列的70%或更大序列同一性的核酸序列、其补体或它们任一者的片段；或者

编码表现出与在序列表中任意一个氨基酸序列的50%或更大序列同一性的氨基酸序列的核酸序列。

18.根据权利要求17所述的多肽，其中所述多肽具有杀虫活性。

19.一种包含根据权利要求18所述的多肽的组合物。

20.一种控制害虫的方法，所述方法包括使所述害虫接触或进食所述杀虫有效量的根据权利要求18所述的多肽。