[发明专利]细胞识别装置以及程序

说明书

技术领域

本发明涉及一种用于基于对源自细胞的成分进行质量分析而得到的结果来识别该细胞的种类的装置以及程序。

背景技术

以往，作为识别细胞的种类的方法之一，已知一种基于DNA碱基序列的相同性解析，该方法被广泛应用于微生物的分类和鉴定等(例如，参照专利文献1)。在该方法中，首先，从被检细胞提取DNA并确定rRNA基因等在整个生物中以高保存性存在的区域的DNA碱基序列。接着，使用该DNA碱基序列来检索收录有多个已知细胞的DNA碱基序列数据的数据库，选出表示与上述被检细胞的DNA碱基序列相似性高的碱基序列。然后，将该碱基序列所源自的生物种判断为与上述被检细胞是同一菌种或者亲缘相近菌种。

然而，在利用了这种DNA碱基序列的方法中，存在以下问题：从被检细胞提取DNA、确定DNA碱基序列等需要比较长的时间，因此难以迅速地进行细胞识别。

因此，近年来正在使用一种基于对被检细胞进行质量分析而得到的质谱图来进行细胞识别的方法(例如，参照专利文献2)。在该方法中，首先，通过使用了MALDI-MS(基质辅助激光解吸电离质量分析)等温和的离子化法的质量分析装置对包含从被检细胞提取出的蛋白质的溶液、被检细胞的悬浮液等进行分析。然后，将得到的质谱图与数据库中收录的已知细胞的质谱图进行对照，由此进行被检细胞的鉴定。在质量分析中，能够使用极为微量的细胞样品短时间内获得分析结果，并且也易于进行多个检体的连续分析。因此，根据这种使用了质量分析的细胞识别方法，能够简便且迅速地进行细胞识别。

专利文献1：日本特开2006-191922号公报

专利文献2：日本特开2007-316063号公报

发明内容

发明要解决的问题

在上述利用了质量分析的细胞识别方法中，一般着眼于核糖体蛋白质群的质量信息来进行细胞的识别。然而，核糖体蛋白质群的氨基酸序列的保存性高，因此在属于同一生物种的细胞之间，质谱上出现的峰值大部分为同一质量。因此，在这种利用了质量分析的细胞识别方法中，即使能够识别细胞的菌种(species)级的差异，有时也难以识别作为其下位的分类的菌株(strain)级的差异。

本发明是为了解决上述问题而完成的，其目的在于提供一种能够高精度且迅速地进行菌株级的细胞识别的细胞识别装置。

用于解决问题的方案

为了解决上述问题而完成的本发明的第一方式所涉及的细胞识别装置具有存储装置和运算装置，基于对被检细胞进行质量分析而得到的结果来识别该被检细胞的种类，

上述存储装置存储有第一数据库和第二数据库，其中，该第一数据库针对多个已知细胞收录了记载有已知细胞的构成成分的离子质量或者分子量的质量列表，该第二数据库针对多个已知细胞收录了部分质量列表，该部分质量列表中记载有已知细胞的构成成分的离子质量或者分子量中的、除该已知细胞所属的预定等级的分类群共有的离子质量或者分子量以外的离子质量或者分子量，

上述运算装置具备：

a)第一检索单元，其使用基于上述质量分析的结果制作出的记载有上述被检细胞的构成成分的离子质量或者分子量的被检质量列表，来检索上述第一数据库；

b)分类群确定单元，其基于由上述第一检索单元得到的检索结果，将位于上述等级的分类群中的某一个确定为在之后的检索中作为对象的分类群；

c)被检部分质量列表制作单元，其制作从上述被检质量列表删除由上述分类群确定单元确定的分类群共有的离子质量或者分子量所得的被检部分质量列表；以及

d)第二检索单元，其使用由上述被检部分质量列表制作单元制作出的被检部分质量列表来检索上述第二数据库。

此外，上述分类群确定单元例如既可以将由第一检索单元得到的检索结果、与被检质量列表一致度高的分类群自动确定为在之后的检索中作为对象的分类群，或者也可以使由第一检索单元得到的检索结果显示于监视器等显示装置，并且接受来自用户的分类群的指定，基于上述检索结果将用户用键盘等输入装置指定的分类群确定为在之后的检索中作为对象的分类群。