[发明专利]用于沙门氏菌检测的序列和它们的用法

权利要求书

1.用于检测样品中沙门氏菌(Salmonella)的存在的方法，所述样品包含核酸，所述方法包括：

(a)提供反应混合物，所述反应混合物包含至少一种引物和探针，其中所述引物长度为至少11个核苷酸，并且所述探针长度为至少14个核苷酸，并且其中

(i)所述引物包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：1的序列或与其互补的序列的核酸序列，并且所述探针包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：2的序列或与其互补的序列的核酸序列；或

(ii)所述引物包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：3的核酸序列或与其互补的序列的核酸序列，并且所述探针包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：4的序列或与其互补的序列的核酸序列；以及

(b)使用步骤(a)的反应混合物进行所述样品的所述核酸的PCR扩增；以及

(c)检测步骤(b)的扩增。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述反应混合物包含(i)的引物和探针以及(ii)的引物和探针两者。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述引物和探针各自具有3’末端和5’末端，并且其中所述探针的3’末端直接或间接地附接至所述引物的5’末端，从而形成引物-探针复合物。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述引物-探针复合物包含可检测的标记。

5.根据权利要求1或3所述的方法，其中能够选择性杂交至SEQ ID NO：1的所述引物包含选自SEQ ID NO：40-54的核酸序列，并且其中能够选择性杂交至SEQ ID NO：2的所述探针包含选自SEQ ID NO：6-39的核酸序列。

6.根据权利要求1或3所述的方法，其中能够选择性杂交至SEQ ID NO：3的所述引物包含选自SEQ ID NO：95-111的核酸序列，并且其中能够选择性杂交至SEQ ID NO：4的所述探针包含选自SEQ ID NO：55-94的核酸序列。

7.根据权利要求3所述的方法，其中所述引物-探针复合物还包含5’茎序列和3’茎序列，其中所述5’茎序列的3’末端直接或间接地附接至所述探针的5’末端，其中所述3’茎序列的5’末端直接或间接地附接至所述探针的3’末端，并且其中所述3’茎序列的3’末端直接或间接地附接至所述引物的5’末端。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述5’茎序列包含选自SEQ ID NO：112-119的核酸序列，并且其中所述3’茎序列包含选自SEQ ID NO：120-130的核酸序列。

9.根据权利要求1或3所述的方法，其中所述反应混合物还包含淬灭剂寡核苷酸，其能够在严格条件下选择性杂交至所述探针。

10.分离的多核苷酸，包含选自SEQ ID NO：6-111的多核苷酸序列。

11.分离的多核苷酸，其中所述多核苷酸包含引物-探针复合物，其中所述引物-探针复合物包含核酸引物部分和核酸探针部分，其中所述引物部分长度为至少11个核苷酸，并且所述探针部分长度为至少14个核苷酸，其中所述探针部分的3’末端直接或间接地附接至所述引物部分的5’末端，并且其中

(i)所述引物部分包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：1的序列或与其互补的序列的核酸序列，并且所述探针部分包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：2的序列或与其互补的序列的核酸序列；或

(ii)所述引物部分包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：3的核酸序列或与其互补的序列的核酸序列，并且所述探针部分包含能够在严格条件下选择性杂交至SEQ ID NO：4的序列或与其互补的序列的核酸序列。

12.根据权利要求11所述的分离的多核苷酸，其中所述引物部分包含选自SEQ ID NO：40-54的核酸序列，并且其中所述探针部分包含选自SEQ ID NO：6-39的核酸序列。

13.根据权利要求11所述的分离的多核苷酸，其中所述引物部分包含选自SEQ ID NO：95-111的核酸序列，并且其中所述探针部分包含选自SEQ ID NO：55-94的核酸序列。