[发明专利]5‑甲氧基,3’‑OH未阻断,可快速光切割的终止核苷酸以及用于核酸测序的方法有效
申请号: | 201280056158.X | 申请日: | 2012-09-13 |
公开(公告)号: | CN104024269B | 公开(公告)日: | 2017-05-24 |
发明(设计)人: | 布赖恩·菲利普·斯图皮;李红;吴卫东;梅根·N·赫什;大卫·赫佐格;西德尼·E·莫里斯;迈克尔·L·梅茨克 | 申请(专利权)人: | 激光基因公司 |
主分类号: | C07H19/073 | 分类号: | C07H19/073;C07H19/10;C07H19/20;C07H19/173 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司11227 | 代理人: | 彭鲲鹏,郑斌 |
地址: | 美国德*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲氧基 oh 阻断 快速 切割 终止 核苷酸 以及 用于 核酸 方法 | ||
1.下式的化合物:
其中:
R1为羟基、一磷酸酯基、二磷酸酯基、三磷酸酯基或α-硫代三磷酸酯基;
R2为氢或羟基;
R3为叔丁基;
R4为氢;
R5为:
氢、卤素或甲氧基;
下式的基团:
其中
X为
-O-、-S-或-NH-;或
C≤12的亚烷基、C≤12的亚烯基或C≤12的亚炔基;并且
n为0;或
-接头-报告基团;其中所述接头为:
其中
X为
-O-、-S-或-NH-;或
C≤12的亚烷基、C≤12的亚烯基或C≤12的亚炔基;并且
n为0;并且
R6为氢;
或其盐。
2.权利要求1的化合物,其进一步定义为式I的化合物。
3.权利要求1的化合物,其进一步定义为式II的化合物。
4.权利要求1的化合物,其进一步定义为式III的化合物。
5.权利要求1的化合物,其进一步定义为式IV的化合物。
6.权利要求1的化合物,其进一步定义为式V的化合物。
7.权利要求1的化合物,其进一步定义为式VI的化合物。
8.权利要求1的化合物,其进一步定义为式VII的化合物。
9.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R1为羟基。
10.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R1为一磷酸酯基。
11.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R1为二磷酸酯基。
12.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R1为三磷酸酯基。
13.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R1为α-硫代三磷酸酯基。
14.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R2为氢。
15.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R2为羟基。
16.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R5为氢。
17.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R5为碘。
18.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R5为甲氧基。
19.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R5为下式的基团:
其中
X为
-O-、-S-或-NH-;或
C≤12的亚烷基、C≤12的亚烯基或C≤12的亚炔基;并且
n为0。
20.权利要求19的化合物,其中X为C2-8的亚炔基。
21.权利要求20的化合物,其中X为-C≡C-。
22.根据权利要求1至8中任一项的化合物,其中R5为-接头-报告基团,其中所述接头为:
其中
X为
-O-、-S-或-NH-;或
C≤12的亚烷基、C≤12的亚烯基或C≤12的亚炔基;并且
n为0。
23.权利要求22的化合物,其中X为C2-8的亚炔基。
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