[发明专利]糖尿病生物标志物及其应用有效
申请号: | 201280075074.0 | 申请日: | 2012-09-03 |
公开(公告)号: | CN104540962B | 公开(公告)日: | 2017-09-19 |
发明(设计)人: | 李胜辉;冯强;覃俊杰;朱剑锋;张东亚;揭著业;王俊;汪建;杨焕明 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因研究院;深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12Q1/04;C12M1/34;C12R1/19;C12R1/145;C12R1/21;C12R1/01 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 糖尿病 生物 标志 及其 应用 | ||
1.试剂在制备试剂盒中的用途,其特征在于:所述试剂适用于检测一组微生物,所述一组微生物包括:嗜黏蛋白阿克曼氏菌Akkermansia muciniphila、肠道拟杆菌Bacteroides intestinalis、拟杆菌属Bacteroides sp.20_3、鲍氏梭菌Clostridium bolteae、哈氏梭菌Clostridium hathewayi、多枝梭菌Clostridium ramosum、梭菌属Clostridium sp.HGF2、共生梭菌Clostridium symbiosum、脱硫弧菌属Desulfovibrio sp.3_1_syn3、缓慢爱格士氏菌Eggerthella lenta、大肠埃希氏菌Escherichia coli、梭菌目Clostridiales sp.SS3/4、直肠真杆菌Eubacterium rectale、普氏栖粪杆菌Faecalibacterium prausnitzii、副流感嗜血杆菌Haemophilus parainfluenzae、肠道罗斯拜瑞氏菌Roseburia intestinalis、以及食葡糖罗斯拜瑞氏菌Roseburia inulinivorans,所述试剂盒用于确定对象中异常状态,所述异常状态为II型糖尿病。
2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,对所述对象的排泄物进行检测,以便确定是否存在所述一组微生物。
3.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,确定是否存在所述一组微生物,进一步包括:
从所述对象的排泄物中分离核酸样本;
基于所获得的所述核酸样本,构建DNA文库;
对所述DNA文库进行测序,以便获得测序结果;以及
基于所述测序结果,确定是否存在所述一组微生物。
4.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,所述测序步骤是通过第二代测序方法或第三代测序方法进行的。
5.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,所述测序步骤是通过选自Hiseq2000、SOLiD、454、和单分子测序装置的至少一种进行的。
6.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,确定是否存在所述一组微生物进一步包括:
将所述测序结果与所述一组微生物进行比对;以及
基于比对结果,确定是否存在所述的一组微生物。
7.根据权利要求6所述的用途,其特征在于,所述比对步骤是利用选自SOAP2和MAQ的至少一种进行的。
8.根据权利要求1所述的用途,进一步包括步骤:
确定所述一组微生物的相对丰度;以及
将所述相对丰度与预定的临界值进行比较。
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