[发明专利]一种鸡Pax7基因31 bp indel多态性的快速检测方法及其应用有效
| 申请号： | 201310002170.9 | 申请日： | 2013-01-05 |
| 公开（公告）号： | CN103074426A | 公开（公告）日： | 2013-05-01 |
| 发明（设计）人： | 康相涛;张锁;韩瑞丽;王乐乐;田亚东;孙桂荣;李国喜;蒋瑞瑞 | 申请（专利权）人： | 河南农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 郑州睿信知识产权代理有限公司 41119 | 代理人： | 牛爱周 |
| 地址： | 450002*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 pax7 基因 31 bp indel 多态性 快速 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法，其特征在于，包括以下步骤：
1）根据鸡Pax7基因的第3外显子及第3内含子的基因序列，设计一对引物；
2）以包含鸡Pax7基因的DNA序列为模板，利用步骤1）设计的引物，进行PCR扩增；
3）通过琼脂糖凝胶电泳检测鸡Pax7基因31bp indel的核苷酸多态性，当第3内含子包含31bp插入时，PCR扩增产物为一条带，条带大小为588bp，命名为II基因型；当第3内含子31bp缺失时，PCR扩增产物为一条带，条带大小为557bp，命名为DD基因型；当该位点为杂合的个体时，PCR扩增产物为两条带，条带大小分别为588bp和557bp，命名为ID基因型。
2.根据权利要求1所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法，其特征在于，所述31bp indel位点位于鸡Pax7基因序列的第3194-3224区域，其中鸡Pax7基因序列的GenBank登录号：NC_006108。
3.根据权利要求1所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法，其特征在于，所述一对引物为：
上游引物：5'-CTTTTTCTCTCTCCCCTTCC-3'；
下游引物：5'-CAGACCCTCAGCACAACTCA-3'。
4.根据权利要求1所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法，其特征在于，PCR扩增反应体系为：包含鸡Pax7基因序列的DNA50ng，10μmol/L的上下游引物各1.0μL，2×Taq PCR Master Mix12μL，灭菌超纯水10.5μL；
PCR扩增反应程序为：95℃预变性5min，94℃变性30s，72℃退火、延伸60s，72℃充分延伸10min，其中，变性、退火、延伸循环30次。
5.根据权利要求1所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法，其特征在于，所述琼脂糖凝胶电泳检测所用的琼脂的质量分数为1.5-2%。
6.一种如权利要求1所述的鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法的应用，其特征在于，所述的检测方法可用于鸡的辅助选择和分子育种。
7.根据权利要求6所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法的应用，其特征在于，通过将基因型与鸡的不同性状进行关联性分析，确定基因与性状的对应关系，用于鸡的分子育种。
8.根据权利要求6所述的一种鸡Pax7基因31bp indel多态性的快速检测方法的应用，其特征在于，所述性状为经济性状，包括生长性状、屠宰性状和肉质性状。
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