[发明专利]CD147-HAb18MAb复合物晶体结构及应用

权利要求书

1.一种CD147胞外区与鼠源抗CD147单克隆抗体HAb18MAb Fab段的复合物CD147-HAb18Mab的晶体，其特征在于，该晶体具有单斜晶系中的空间群P2₁和SEQ ID NO:1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3中所示的氨基酸序列；所述模型具有符合下表的三维结构；

括号内数据指最高分辨率壳层的相应数据；

^aR_merge=(∑|I_i–<I_i>|)/∑|I_i|，其中I_i是给定衍射点的积分强度；

^bR_cryst=(∑||F_o|-|F_c||)/∑|F_o|，其中F_o和F_c分别指测量得到的和计算得到的结构因子；

^cR_free与R_cryst计算方式相同，但采用的数据来自随机选取的5%校验点集。

2.如权利要求1所述的复合物CD147-HAb18Mab晶体，其特征在于：（1）该晶体具有四棱柱形的晶胞，在一个不对称单位内有两个CD147分子，两个单抗HAb18MAb的Fab段，分子量之和约为148.8±0.5kD，溶剂含量约52±1%；（2）CD147-HAb18MAb晶体的三维空间结构特点：CD147靠近N端的C2-set结构域与单抗HAb18MAb的Fab段形成了抗原抗体复合物；（3）CD147胞外区序列来源于人，HAb18MAb是鼠源性抗CD147单克隆抗体。

3.如权利要求1所述的复合物CD147-HAb18Mab晶体，其特征在于，CD147胞外区与HAb18MAb Fab段相互作用的位点位于该蛋白N端C2-set结构域，参与表位的残基为：Leu33，Val61，Leu62，Asp65，Leu67，Lys71，Glu73，Lys75；抗体HAb18MAb上参与识别抗原表位的残基包括重链上的Asp50，Trp52，Ser72，Asn75，Arg119，以及轻链上的Asn51，Asp52，Phe69，Tyr70。

4.一种鉴别能与CD147胞外区结合的物质的方法，其特征在于，包括用CD147晶体浸泡可能的小分子化合物并共结晶、以及采用测定分子间相互作用的方法筛选可能的配体或拮抗剂及通过计算机模建方法利用CD147晶体结构与可能的配体进行三维结构比对、设计、对接。

5.一种利用计算机辅助三维模建、分子对接技术选择及确定CD147胞外区抗体、配体及其它相互作用分子的方法，其特征在于：包括如下步骤：(1)通过计算机三维模建CD147胞外区与可能的抗体、配体及其它作用分子的三维结构；(2)CD147胞外区三维结构和抗体、配体及其它相互作用分子三维结构的对接；(3)评估抗体、配体及其它作用分子的三维结构是否能与CD147功能性表位的三维结构结合；(4)CD147胞外区生物活性位点的分析。

6.如权利要求5所述的一种利用计算机辅助三维模建、分子对接技术选择及确定CD147胞外区抗体、配体及其它相互作用分子的方法，其特征在于：基于CD147-HAb18MAb复合物晶体结构设计、研发、改造的抗体、配体及其它作用分子作为试剂、拮抗物、模拟物或药物。

7.一种基于结构的生物活性物质的药物设计的计算机辅助方法，其特征在于：该方法包括：

a.提供一种CD147-HAb18MAb复合物晶体，其中所述晶体表现为一种基本符合表1的三维结构；

b.用所述晶体的结构信息设计一种抗体、肽类物质、蛋白类物质、小分子物质；

c.合成所述的抗体、肽类物质、蛋白类物质、小分子物质；

d.评估上述的合成的抗体、肽类物质、蛋白类物质、小分子物质等的生物活性。

8.如权利要求7所述的一种基于结构的生物活性物质的药物设计的计算机辅助方法，其特征在于：其中所述的设计步骤包括计算机筛选一个或多个化学化合物数据库，其中所述化合物的三维结构是已知的。