[发明专利]黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性位点的快速检测方法与应用有效
申请号: | 201310003906.4 | 申请日: | 2013-01-06 |
公开(公告)号: | CN103243155A | 公开(公告)日: | 2013-08-14 |
发明(设计)人: | 陈宏;王璟;曹修凯;潘虹;滑留帅;蓝贤勇;胡沈荣;雷初超 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 712100 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄牛 cidec 基因 核苷酸 多态性 快速 检测 方法 应用 | ||
1.一种检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1、P2、P3为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因;用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位、第-956位、第-501位的单核苷酸多态性,
所述的引物对P1为:
上游引物:agctgtgctgcccaggatggctgccagcgg
下游引物:gggactttctaccatggtgggttctatatcc;
所述的引物对P2为:
上游引物:ggcactgctggtggaggaactgacttcagg
下游引物:cttattgaatgttaactggtttagatgtat;
所述的引物对P3为:
上游引物:gactctgtccccaaggacagaaactagctgag
下游引物:accaagttggagaccccctcagtacccaggctcggc。
2.如权利要求1所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的PCR扩增反应程序为:
94℃预变性5min;30~34个循环94℃变性30s,62、60、58℃退火30s,72℃延伸30s;72℃延伸10min。
3.如权利要求1所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的琼脂糖凝胶的质量浓度为3.5%。
4.如权利要求1所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第-974位的单核苷酸多态性为:CC基因型表现为165bp条带和30bp 条带;CT基因型表现为195bp、165bp和30bp条带;TT基因型表现为195bp。
5.如权利要求1所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,第-956位的单核苷酸多态性为:GG基因型表现为174bp条带;GA基因型表现为174bp、144bp和30bp条带;CC基因型表现为144bp和30bp。
6.如权利要求1所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法,第-501位的单核苷酸多态性为:GG基因型表现为143bp条带和35bp;GA基因型表现为178bp、143bp和35bp条带;AA基因型表现为178bp。
7.权利要求1至7中任意一项权利要求所述的检测黄牛CIDEC基因单核苷酸多态性的方法在鉴定不同黄牛群体多态性中的诊断应用。
8.权利要求8所述的诊断应用,其特征在于,鉴定不同黄牛多态性是,黄牛CIDEC基因BtCIDEC-H8/BtCIDEC-H8组合型可以作为为提高黄牛体重和日增重的候选分子遗传标记。CIDEC基因可以作为黄牛分子育种中辅助选择的候选基因。
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