[发明专利]适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法无效
申请号: | 201310018128.6 | 申请日: | 2013-01-18 |
公开(公告)号: | CN103045586A | 公开(公告)日: | 2013-04-17 |
发明(设计)人: | 石松传;鲍勇刚 | 申请(专利权)人: | 赵树民;于利 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100020 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 适用于 基因组 婴幼儿 唾液 dna 提取 方法 | ||
1.一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)向0.5-1ml婴幼儿唾液样品中加入500ul提取缓冲溶液,反复吹打混匀后,8000×g离心5分钟,弃去上清,此步骤重复一次;
(2)向步骤(1)得到的沉淀中加入500ul裂解液,彻底悬浮沉淀并充分混匀后,室温放置30分钟,期间来回颠倒离心管数次;
(3)向步骤(2)得到的混合液中,加入RNA酶的水溶液10μL,37℃下静置10min;
(4)向步骤(3)得到的上清液中,加入等体积苯氛-氯仿混合溶液,充分混匀,混合液4℃,12000×g离心5分钟,上清液移入干净离心管内;
(5)向步骤(4)得到的上清液中加入等体积苯氛-氯仿-异戊醇混合溶液,充分混匀后,4℃,12000×g离心5分钟,上清液移入干净离心管内;
(6)向步骤(5)得到的上清液中加入等体积氯仿-异戊醇混合溶液,充分混匀后,4℃,12000×g离心5分钟,上清液移入干净离心管内;
(7)向步骤(6)得到的上清液中加入0.6倍体积的冰浴异丙醇溶液及0.1倍的醋酸钠溶液,-20℃静置60分钟后,4℃,12000×g离心10分钟,弃上清;
(8)向步骤(7)得到的沉淀物中加入0.5mL 70%乙醇清洗沉淀物,4℃,12000×g离心5分钟,弃上清,此步骤重复一次;
(9)步骤(8)得到的沉淀物自然风干,加入20μL无菌超纯水回溶,电泳检测,-20℃保存待用。
2.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的婴幼儿唾液样品为5岁以下儿童的唾液、泪液、鼻涕。
3.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(1)中所述的DNA提取缓冲溶液, 溶剂为50mM的Tris-HCl pH7.4,配方中各溶剂组分中浓度为:0.5mM的EDTA、50mM的NaCl。
4.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(2)中,所述的裂解液,溶剂为50mM Tris-HCl pH7.4,配方中各溶质组分浓度为:50mM Tris-HCl pH7.4,150mM NaCl,1mM EDTA,1%Triton x-100,1%Sodium deoxycholate,0.1%SDS,蛋白酶K20mg/mL。
5.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述的RNA酶的水溶液中,RNA酶的浓度为10mg/mL。
6.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(4)中,所述的苯酚-氯仿混合溶液中,苯酚和氯仿的体积比为1∶1。
7.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(5)中,所述的苯酚-氯仿-异戊醇混合溶液中,苯酚、氯仿和异戊醇的体积比为25∶24∶1。
8.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(6)中,所述的苯氯仿-异戊醇混合溶液中,苯氯仿和异戊醇的体积比为1∶1。
9.根据权利要求1所述的一种适用于全基因组测序的婴幼儿唾液内基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述步骤(7)中,所述的醋酸钠的水溶液中,醋酸钠的浓度为3mol/L。
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