[发明专利]一种锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒及检测方法无效
申请号: | 201310019401.7 | 申请日: | 2013-01-18 |
公开(公告)号: | CN103060475A | 公开(公告)日: | 2013-04-24 |
发明(设计)人: | 曾令兵;张辉;周勇;徐进;范玉顶 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 王敏锋 |
地址: | 430223 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 锦鲤 疱疹病毒 lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明属于鱼类病毒检测技术领域,具体涉及一种锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒,还涉及一种利用锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒检测锦鲤疱疹病毒的方法。
背景技术
1998年5月在以色列的Magan Michael地区首次暴发锦鲤疱疹病毒病,同年成功分离出了病原锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus,KHV),为疱疹病毒科(Herpesviridae),鲤疱疹病毒属(Cyprinid herpesvirus)成员,又称鲤疱疹病毒Ⅲ型(CyHV-Ⅲ)。锦鲤疱疹病毒病迅速扩展至世界各地。2002年首次证实该病已传至我国,近年来给我国框镜鲤、鲤鱼的养殖业造成严重的经济损失。
目前的诊断方法有细胞培养分离技术、电镜技术、PCR、ELISA、原位杂交技术等,聚合酶链式反应(PCR)和细胞培养技术是OIE推荐的诊断方法。但是这些方法都有各自的局限性,为了及早发现和确诊锦鲤疱疹病毒病,有必要建立一种准确、快速、灵敏的检测方法,为疾病的诊断与防控提供技术手段,也为鲤鱼养殖业的健康发展提供技术保障。
环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是Notomi等于2000年报道的一种新型等温核酸扩增方法(国际专利公开号WO00/28082),针对靶基因的6个位点设计4条LAMP引物,利用一种具有链置换活性的DNA聚合酶(Bst DNA聚合酶),在恒温条件下快速、高效、高特异、高灵敏地扩增靶序列,适合于现场和实验条件较简单的实验室进行快捷检测。引入一对环状引物的改进方法,进一步缩短了反应时间。
发明内容
本发明的一个目的是在于提供了一种锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒,根据GenBank公布的KHV毒株的TK基因编码区序列(DQ177346),应用PrimerExplorer V4(http://primerexplore r.jp/elamp4.0.0/index.html)在线软件设计特异性引物,利用LAMP技术扩增靶基因的特定区域,从分子水平对锦鲤疱疹病毒进行快速检测,具有简便、快速、高特异性和灵敏性的特点。
本发明的另一个目的是在于提供了一种利用锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒检测锦鲤疱疹病毒的方法,本方法仅需一个水浴锅或金属浴即可在2小时内准确检测出样品中的KHV,能检测KHV感染的病鱼组织,能检测KHV感染的细胞(例如Koi-Fin细胞),非常适用于KHV的现场快速检测。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
一种锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒,包括以下成分:
该试剂盒包括以下成分:10×ThermoPol Reaction Buffer;Bst DNA聚合酶(NEB);dNTPs;外引物F3和B3、内引物FIP和BIP、Betaine(Sigma),MgCl2,1000×SYBR Green I(Invitrogen)。
F3:5'-GCATCGCCGTCAAGCAC-3';
B3:5'-GCAGCTGCACGACTCC-3';
FIP:5'-AGATGGCCGGGTAGGTCGCTTTTGCCATAGACCAGCGCTACA-3';
BIP:5'-ACCTGTACGAGGTGATGCAGCTTTTAGGTCGGGGAAGAACTGTC-3'。
一种利用锦鲤疱疹病毒LAMP检测试剂盒检测锦鲤疱疹病毒的方法,其步骤是:
1、病毒DNA的获取:
采用试剂或Viral DNA Kit试剂盒等提取样本总DNA,模板DNA在95℃5分钟后迅速置于冰浴中的预处理可以增加检测的灵敏度。
2、LAMP扩增:
采用25μl反应体系,包括:内引物FIP和BIP各0.8μM,外引物F3和B3各0.1μM,dNTPs1mM,Betaine0.5M,MgCl22-10mM,Bst DNA聚合酶8U,模板DNA5μl,10×ThermoPol Reaction Buffer2.5μl,去离子水补足余量。选择55-65℃的温度范围和30-120分钟的时间范围进行LAMP反应之后,80℃灭活2分钟。
3、检测结果判定,可用下述三种方法之一进行结果的判定:
1)发生扩增反应时,从dNTPs析出的焦磷酸根离子和反应液中的镁离子形成白色焦磷酸镁沉淀,通过肉眼判断:检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性。
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