[发明专利]一种化学药物hERG钾离子通道阻断作用的定性预测方法及其系统无效
申请号: | 201310029985.6 | 申请日: | 2013-01-26 |
公开(公告)号: | CN103049674A | 公开(公告)日: | 2013-04-17 |
发明(设计)人: | 刘海波;刘延淮;徐峻;刘志强 | 申请(专利权)人: | 北京东方灵盾科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 北京金知睿知识产权代理事务所(普通合伙) 11379 | 代理人: | 林俐;张京安 |
地址: | 100080 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 化学 药物 herg 离子 通道 阻断 作用 定性 预测 方法 及其 系统 | ||
1.一种化学药物hERG钾离子通道阻断作用的定性预测方法,所述方法的步骤包括:
步骤一,确定待测化学药物的分子结构信息;
步骤二,将所述分子结构与已知的与hERG阻断作用相关的化合物的分子特征结构进行识别比较,判断其是否具有所述特征结构,作出定性预测。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法步骤包括:
在步骤一中的分步骤:通过区分待测化学药物的类别,对待测化学药物进行是否适于本预测方法的筛选与甄别;
在步骤二中,所述将分子特征结构与已知的与hERG阻断作用相关的分子特征结构的识别比较包括分步骤:(1)对非hERG阻断剂的特征结构识别判断;(2)对hERG阻断剂的特征结构的识别判断。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法步骤包括:
步骤一中,不适于本方法的化学药物类别包括:大环抗生素类药物、多肽类药物、以桥环结构为主体的药物、无机药物、分子量大于800的药物,若待测药物属于此类药物,则停止预测,给出“该药物不适合使用本方法预测”的结果;如果待测药物不属于此类药,则进行后续预测步骤;
步骤二中还具有下述分步骤:a.进行非hERG阻断剂的特征结构识别判断,如果待测化学药物的分子结构中存在非hERG阻断剂的特征结构,可得出该化学药物不具有hERG钾离子通道阻断作用的评价结论,结束评价;b.如果该化学药物的分子结构中不存在非hERG阻断剂的特征结构,则继续后续步骤的识别判断;c.进行hERG阻断剂的特征结构的识别判断,如果待测化学药物的分子结构中存在hERG阻断剂的特征结构,可以得出该化学药物具有hERG钾离子通道阻断作用的评价结论,如果不存在hERG阻断剂的特征结构,则得出该化学药物不具有hERG钾离子通道阻断作用的评价结论。
4.一种化学药物hERG钾离子通道阻断作用的定性预测系统,其特征在于,所述定性预测系统至少包括:
输入模块,用于输入和分析药物分子的二维结构信息,并响应用户的各种操作;
显示模块,用于原始的或者处理后的药物分子结构的可视化输出;
存储模块,用于存储、读取和管理计算机程序文件、化学药物分子结构文件、数据文件、配置文件、临时文件和历史文件;
数据处理模块,用于实时分析输入的分子结构,进行数据格式处理及显示格式处理,将处理结果保存到内存中;
hERG阻断作用预测模块,用于对化学药物进行hERG钾离子通道阻断作用定性预测;
所述数据处理模块与所述输入模块、显示模块、hERG阻断作用预测模块、存储模块相连接。
5.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述输入模块还包括:
分子结构编辑子模块,用于绘制分子骨架结构和取代基结构,形成分子结构,并对输入的数据进行实时分析,将分析结果转换为结构显示状态,同时把图形数据转换为结构数据保存到内存中;
模板管理子模块,用于管理系统中常用的分子结构模板,系统允许通过直接定义或读取存储设备中的mol文件增加分子结构模板,同时允许对模板进行修改、删除操作。
6.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述显示模块还包括:
错误提示子模块,用于应用化学原理对用户输入分子结构的合理性进行评价,遇到错误的结构,实时给出提示;
分子结构预览子模块,用于在保存或打开分子结构文件的过程中提供预览。
7.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述数据处理模块包括:
结构图形转换子模块,用于将用户输入的分子结构转换成位图数据;
分子排列子模块,用于提供多个分子的纵向、横向对齐等功能;
分子旋转、放缩功能子模块,对选中的分子结构进行旋转、放缩计算。
8.如权利要求4所述的系统,其特征在于,所述hERG阻断作用预测模块包括:
分子结构特征库子模块,用于存储目前已知的具有特定意义的分子结构信息,包括可预测、低活性、高活分子结构信息性;
分子结构特征识别子模块,用于判断待预测化学药物分子是否具有某种给定的特征结构;
预测结果汇总子模块,用于汇总判断结果,形成预测结论。
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