[发明专利]纯白色真姬菇Finc-W-90的分子标记及其获得方法与应用有效
申请号: | 201310030533.X | 申请日: | 2013-01-25 |
公开(公告)号: | CN103289996A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 刘玉 | 申请(专利权)人: | 上海丰科生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
地址: | 201401 上海市奉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 白色 真姬菇 finc 90 分子 标记 及其 获得 方法 应用 | ||
【技术领域】
本发明属于微生物技术领域,具体涉及一种纯白色真姬菇Finc-W-90的分子标记及其获得方法与应用。
【背景技术】
真姬菇(拉丁文名称Hypsizygus marmoreus),隶属担子菌亚门、层菌纲、伞菌目、白蘑科、离褶菌族、玉蕈属,因它具有独特的蟹鲜味,故又称它为蟹味菇。最初的人工栽培于1978年前后开始于日本,其味道鲜美、食感脆嫩、营养丰富,其味比平菇鲜,其肉比滑菇厚,其质比香菇韧,口感甚佳,其干品还香味浓溢。真姬菇含有丰富的维生素和17种氨基酸,子实体中提取的β-葡聚糖具有很高的抗肿瘤活性,是一种低热量、低脂肪的保健食品。
传统食用菌菌种鉴别,尤其对于真姬菇,其主要依据是子实体的外观形态、拮抗试验、出菇对比等。外观形态易受栽培环境(温度、湿度、CO2浓度、光照强度及通风等)和配方的影响,造成外观形态鉴定的困难。亲缘关系较近的菌株之间(比如有些亲本和子代之间),拮抗现象不明显,通过拮抗试验鉴别菌种也存在困难。出菇对比试验耗时至少4个月,不利于菌种的鉴定和检测。随着分子生物学的发展,分子标记法越来越广泛地用于菌种的鉴别。SCAR(Sequence-characterized Amplified Region)标记是一种十分稳定的分子标记,能够简便、快速、稳定的进行菌种鉴定,但目前尚未有对纯白色真姬菇Finc-W-90的SCAR分子标记,以便快速鉴定纯白色真姬菇Finc-W-90。
【发明内容】
本发明解决的技术问题是解决现有技术存在的缺陷,提供一种纯白色真姬菇Finc-W-90的分子标记及其获得方法与应用。
本发明采用PCR技术进行了大量的筛选试验,其中,采用随机引物(序列为:TGCTCTGCCC)获得了真姬菇菌株Finc-W-90的特异DNA片段,分子量为769bp,将该片段克隆测序,以此片段的DNA序列为基础,设计特异PCR扩增引物,其特异引物对序列为:5'CTCTGCCCTACATCTAATCTGC3'和5'CCCAAGCTACATTGACAATGATAG3'。该引物对对真姬菇Finc-W-90菌株进行PCR扩增,可以获得分子量大小为758bp的特异片段,即为真姬菇菌株Finc-W-90的分子标记。
本发明还公开一种纯白色真姬菇Finc-W-90菌种的分子标记的获得方法,其特征在于包括如下步骤:
1)获得菌丝或者子实体;
2)基因组DNA提取;
3)RAPD法分析并获得特异DNA片段:采用RAPD法分析并获得真姬菇菌株Finc-W-90的特异DNA片段所用随机引物序列为:TGCTCTGCCC。
4)特异引物设计:以上述获得的特异DNA片段序列为基础,设计特异PCR扩增引物,引物对序列 是5'-CTCTGCCCTACATCTAATCTGC-3'和5'-CCCAAGCTACATTGACAATGATAG-3';
5)SCAR分子标记的PCR扩增:用特异PCR扩增引物对真姬菇Finc-W-90菌株的基因组进行SCAR-PCR扩增,得到758bp的特异分子标记。
6)电泳检测。
所述步骤3)中RAPD法的PCR扩增反应体系为:总体积25μL:基因组模板20-30ng/μL 1.0μL,随机引物0.5pmol/μL 1.0μL,10mM dNTP mix0.5μL,10×Taq缓冲液2.5μL,25mM MgCl2 2.0μL,Taq酶5U/μL 0.25μL,加水至25μL;PCR反应条件:预变性95℃3min;94℃45s,36℃60s,72℃2min,35个循环;72℃延伸10min;纯白色真姬菇Finc-W-90菌株特异DNA片段大小为758bp。
所述步骤5)中SCAR分子标记的PCR扩增,其体系为:总体积25μL,模板20~30ng/μL 1μL,真姬菇Finc-W-90特异引物对0.5pmol/μL各0.5μL,10mM dNTP mix0.5μL,10×Taq Buffer 2.5μL,25mM MgCl2 2.0μL,Taq酶5U/μL 0.25μL,加水至25μL;PCR反应条件:预变性95℃3min;94℃30s,62℃30s,72℃1min,35个循环;72℃延伸5min。
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