[发明专利]一种CYP2C19基因多态性检测试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201310033217.8 | 申请日: | 2013-01-25 |
公开(公告)号: | CN103074434A | 公开(公告)日: | 2013-05-01 |
发明(设计)人: | 南丽;孙婷婷;吴勇 | 申请(专利权)人: | 海尔施生物医药股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N27/447 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 315800 浙江省宁*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 cyp2c19 基因 多态性 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种CYP2C19基因多态性检测试剂盒,包括超纯水、X溶液、10×PCR缓冲液,PCR引物、25mM氯化镁溶液、DNA聚合酶和阳性对照品,其特征在于所述的PCR引物包括以下CYP2C19基因上的3个SNP位点上的不同基因型的正反向扩增引物、DNA内参的正反向扩增引物及反应内参的正反向扩增引物,其基因序列如下表所示:
其中,2*G/2*A表示该2号SNP位点有两种可能基因型G或A,两条反向引物分别指检测该SNP位点相应基因型G或基因型A的引物,在检测该SNP位点时两条引物要同时加到反应液中,3*G/3*A表示该3号SNP位点有两种可能基因型G或A;17*C/17*T表示该17号SNP位点有两种可能基因型C或T。
2.根据权利要求1所述的一种CYP2C19基因多态性检测试剂盒,其特征在于:包括三磷酸脱氧核苷酸和通用引物,所述的通用引物正向扩增引物序列为AGGTGACACTATAGAATA;反向扩增引物序列为GTACGACTCACTATAGGGA,所述的通用引物正向扩增引物带荧光标记。
3.根据权利要求1所述的一种CYP2C19基因多态性检测试剂盒,其特征在于:所述的阳性对照品为克隆到载体pMD18-T上的7个DNA片段和1个质粒pcDNA3.1(+),所述的7个DNA片段分别为包含有SNP位点上rs4244285的G型基因和A型基因、rs4986893的G型基因和A型基因、rs12248560的C型基因和T型基因及人类基因beta-globin的片段。
4.一种利用权利要求1-3中任一项所述的CYP2C19基因多态性检测试剂盒的检测方法,其特征在于具体包括以下步骤:
(1)DNA样品的收集和提取
将刮取到口腔上皮细胞的口腔拭子放入300μL DNA裂解缓冲液中,在恒温混匀仪中于95°C,1000rpm的条件下,处理5分钟后取出,室温放置至冷却,然后在样品中加入30μL提取缓冲液,混匀,12000g离心5分钟,得到的上清液即为PCR的DNA样品模板;
(2)以提取的核酸为模板进行PCR反应
取DNA样品9.3μL,10×PCR缓冲液2μL,25mM的氯化镁4μL,PCR引物溶液2μL,DNA聚合酶0.7μL,X溶液2μL混匀后加入到96孔样品板上进行PCR反应,反应条件:94°C1分钟;94°C30秒钟,60°C30秒钟,70°C1分钟,循环35次;70°C1分钟;4°C直至收取PCR产物;其中所述的X溶液为包括三磷酸脱氧核苷酸和通用引物,所述的通用引物正向扩增引物序列为AGGTGACACTATAGAATA;反向扩增引物序列为GTACGACTCACTATAGGGA,所述的通用引物正向扩增引物带荧光标记,PCR引物溶液中各PCR引物浓度均为200nM;所述的PCR引物包括以下CYP2C19基因上的3个SNP位点上的不同基因型的正反向扩增引物、DNA内参的正反向扩增引物及反应内参的正反向扩增引物,其基因序列如序列表中SEQ ID NO.1~NO.13所示;
(4)GeXP遗传分析仪毛细电泳分离样品
取PCR产物0.1-1μL,,GeXP遗传分析仪配套的上样缓冲液30μL,DNA标准品0.2μL,矿物油一滴混合均匀后加入到96孔分离液板上进行毛细电泳分离样品,将GeXP遗传分析仪的软件获得的图谱与标准图谱对比,获得CYP2C19基因的SNP位点的等位基因型。
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