[发明专利]一种H4和H9亚型禽流感病毒多重鉴别检测的方法有效
申请号: | 201310034646.7 | 申请日: | 2013-01-30 |
公开(公告)号: | CN103103291A | 公开(公告)日: | 2013-05-15 |
发明(设计)人: | 袁小远;王友令;王月明;艾武;刘军河;韩晓珺;董伟峰 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院家禽研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 济南舜源专利事务所有限公司 37205 | 代理人: | 徐槐 |
地址: | 250100 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 h4 h9 禽流感 病毒 多重 鉴别 检测 方法 | ||
1.一种H4和H9亚型禽流感病毒多重鉴别检测的方法,包括以下步骤:
(1)设计引物:参照GenBank中H4和H9禽流感病毒的HA基因序列,设计两对引物H9-HA-F、H9-HA-R和 H4-HA-F、H4-HA-R,用于扩增HA基因片段,序列为:
H9-HA-F:5'-GCCTGCTAGATCAAGTAGAGG-3';
H9-HA-R:5'-TGGAACCCAATGCCCTCTTC-3';
H4-HA-F:5'-AGCAAAAGCAGGGGAAACAATGC-3';
H4-HA-R:5'- agtagaaacaagggtgttttttctc-3';
H4扩增片段长度1738bp、H9扩增片段长度404bp;
(2)提取核酸:将已知的H4和H9毒株样品等体积进行混合,并取200ul混合液加入1.5ml无RNA酶的离心管中,再加入1ml的Trizol,充分混匀后在室温放置5分钟;加入0.2 ml的氯仿,加盖好后剧烈震荡15秒,在室温放置2-3min,然后进行12000 g离心15 min,将水相转移到另一无RNA酶的离心管中,加入与水相等体积的异丙醇,室温静置10 min,12000g离心15min,除去上层清液,向沉淀中加入1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀,混匀,12000 g离心5min,除去上层清液,超净台内风干RNA沉淀,加入10ul DEPC水充分溶解RNA,同时设H4和H9单一病毒作为对照;
(3)RT-PCR反应的反应体系:
2x Buffer 25μl
混合酶 10U
H4-HA-F引物(10μM) 10~20pM
H4-HA-R引物(10μM) 10~20pM
H9-HA-F引物(10μM) 10~20pM
H9-HA-R引物(10μM) 10~20pM
RNA模板 10ul
RNase-free ddH2O 补至50μl;
(4)扩增条件:第一步50 min 50℃,1个循环;第二步94℃3 min,1个循环;第三步94℃1.5 min,52℃1.5 min,72℃2 min,35个循环,第四步72℃延伸7min,1个循环,4℃保存;
(5)产物鉴定:取5??L上述反应产物进行1.2%琼脂糖凝胶电泳检验,以Marker作为参考,TAE缓冲液为电泳缓冲液,以5V/cm电泳1h,凝胶成像系统观察结果。
2.根据权利要求1所述的一种H4和H9亚型禽流感病毒多重鉴别检测的方法,其特征在于:上述步骤(3)中所述混合酶为反转录酶和Taq DNA混合酶。
3.根据权利要求2所述的一种H4和H9亚型禽流感病毒多重鉴别检测的方法,其特征在于:所述反转录酶和Taq DNA各5个单位。
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