[发明专利]一种快速鉴定鸭甲肝病毒血清型的双重RT-PCR方法无效

专利信息
申请号: 201310036594.7 申请日: 2013-01-30
公开(公告)号: CN103060478A 公开(公告)日: 2013-04-24
发明(设计)人: 姜世金;陈琳琳 申请(专利权)人: 山东农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 271018 *** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 快速 鉴定 甲肝 病毒 血清 双重 rt pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种快速鉴定鸭甲肝病毒血清型的双重RT-PCR方法,其特征在于包括以下步骤:

A、通过对参考GenBank上已发表的DHAV-1和DHAV-3的序列进行比对,选择在DHAV-1和DHAV-3的多聚蛋白基因polyprotein gene的保守区分别设计一对针对DHAV-1的特异性引物SEQ1/SEQ2和一对针对DHAV-3的特异性引物SEQ3/SEQ4;

SEQ1:5’-CAA CTC GAC CAA TH(T/C/A)C CTG G-3’,

SEQ2:5’-CCT GR(A/G)T GR(A/G)A CCA TTG TR(A/G)A CTG-3’,

SEQ3:5’-GAA ATC TGC ACT CAA TGG AGA G-3’,

SEQ4:5’-CCC AGG AAA TGA TTG GTC AG-3’;

所有引物以无菌ddH2O配成25pmol/μl的浓度备用;

B、常规方法提取待测鸭肝组织总RNA作为模板,进行反转录反应;反应体系为:模板RNA4μl,SEQ1和SEQ3引物各1μl,5×M-MLV Buffer2μl,浓度为10.0mM dNTPs0.5μl,Rnase Inhibition0.25μl,浓度为5U/μl RTase M-MLV0.5μl,ddH2O0.75μl;反应程序为:42℃保存60min,70℃15min,获得病毒cDNA;

C、以病毒cDNA为模板进行PCR反应;反应体系为:35.1μl ddH2O,5μl Buffer,浓度为10.0mM dNTPs3μl,SEQ1和SEQ2各1.2μl,SEQ3和SEQ4各1.0μl,2μl cDNA模板,0.5μl Taq酶;PCR反应条件为:95°C5min;95°C50s,60°C50s,72°C40s,30个循环;72°C10min;

D、对步骤C得到的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。

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