[发明专利]一种用于CYP3A5SNP rs776746分型快速检测的试剂盒和检测方法有效
申请号: | 201310057276.9 | 申请日: | 2013-02-22 |
公开(公告)号: | CN103122389A | 公开(公告)日: | 2013-05-29 |
发明(设计)人: | 刘鸿君;马学军;许峰;李力 | 申请(专利权)人: | 北京汇智泰康医药技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
地址: | 101111 北京市大兴区经济技术*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 cyp3a5snp rs776746 快速 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学检测领域,具体的说,本发明涉及一种用于CYP3A5SNP(rs776746)分型快速检测的试剂盒和检测方法。
背景技术
人体内代谢药物的主要酶是细胞色素P450超家族(Cytochrome P450,CYP),其是一类主要存在于肝脏、肠道中的单加氧酶。CYP3A是细胞色素P450的亚家族,主要存在于肝脏和小肠,约占肝脏CYP总量的30%,为肝脏和体内含量最为丰富的代谢酶,在已知CYP450参与代谢的药物中,约有50%是CYP3A介导的。CYP3A5的表达呈多态性分布,其功能仅在10%~20%的白人、33%的东方人和55%的美国黑人中存在,对药物代谢及其个体差异有重要的影响。CYP3A5催化药物的代谢和胆固醇、类固醇及其他脂类的合成涉及到许多反应。以强效免疫抑制剂他克莫司为例,临床口服主要用于预防和治疗器官移植后的排异反应。但是因其治疗窗较窄,CYP3A5基因多态性影响CYP3A5酶的表达,导致个体差异大,使服用相同剂量的他克莫司血药浓度不同。研究表明,位于CYP3A5基因第3内含子的A6986G,可引起个体间CYP3A5表达差异,GG型的个体(CYP3A5*3/*3)是最常见的突变型,可导致CYP3A5蛋白质的剪接缺陷,从而失去蛋白功能。这种基因型的个体,因代谢酶的缺失,服用相同剂量的他克莫司时,血药浓度高于AA型(CYP3A5*1/*1)或AG型(CYP3A5*1/*3)。
文献“中国肾移植患者中不同的CYP3A5*3基因型与西罗莫司血药浓 度的关系”(《中国医药工业杂志》2010,41,9)公开了一种四引物PCR方法,但是按照该方法无法进行重现。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于CYP3A5SNP(rs776746)分型快速检测的试剂盒。
本发明的目的还在于提供一种用于CYP3A5SNP(rs776746)分型快速检测的检测方法。
为了实现本发明的方法,本发明提供一种用于CYP3A5SNP(rs776746)分型快速检测的试剂盒,包括:盒盖、盒体、能够嵌入所述盒体的装有酶反应混合物的容器、能够嵌入所述盒体的装有引物混合物的容器、能够嵌入所述盒体的装有阳性对照的容器、和能够嵌入所述盒体的装有水的容器。
如本文中使用的,术语“能够嵌入盒体”是指根据需要容器可以自由地插入盒体和从盒体中取出。
优选地,所述装有引物混合物的容器中装有外围引物1、外围引物2、内引物1和内引物2,所述外围引物1的核苷酸序列如SEQ ID NO:l所示,所述外围引物2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,所述内引物1的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述内引物2的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
在本发明中,
SEQ ID NO:l的序列为:
5’-CTTGCAGCATTTAGTCCTTGTG-3’
SEQ ID NO:2的序列为:
5’-ACCCAGGAAGCCAGACTTTGAT-3’
SEQ ID NO:3的序列为:
5’-TTTAAAGAGCTCTTTTGTCTTTGAG-3’
SEQ ID NO:4的序列为:
5’-TGTGGTCCAAACAGGGAAGAGATCT-3’
优选地,所述外围引物和所述内引物的浓度比为1:5~1:7。更优选地,所述外围引物1和所述外围引物2的浓度均为0.714μM,所述内引物1和所述内引物2的浓度均为4.286μM。
优选地,所述阳性对照为GG型(*3/*3)、AA型(*1/*1)、AG型(*1/*3)的模版DNA。
在本发明中,所述阳性对照例如可以采用下列方式进行获得:
选取经过测序验证的CYP3A5SNP(rs776746)分型为AA型(*1/*1)及GG型(*3/*3)的两个血液基因组DNA;
以上述DNA为模版,使用外围引物进行PCR产物扩增;
将上述两个PCR产物纯化后,分别连接到T-载体上,并转化大肠杆菌。
利用菌落PCR选取阳性克隆,并保存阳性菌株;
接种上述阳性菌株过夜培养,并进行质粒提取,得到分别连有AA型(*1/*1)及GG型(*3/*3)目的片段的质粒DNA。
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