[发明专利]玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为：

PZE-109053835

PZE-103102855

SYN12735

SYN18302

SYN30756

PZE-103171599

SYN30351

PZE-104141072

PZE-108071872

PZE-110066840

。

2.根据权利要求1所述的玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP标记的等位基因位点如下所示：

PZE-109053835   C

PZE-103102855   C

SYN12735        A

SYN18302        G

SYN30756        T

PZE-103171599   T

SYN30351        G

PZE-104141072   G

PZE-108071872   G

PZE-110066840   C

。

3.一种获得玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记的方法，其特征在于，所述方法包括步骤：

（1）以115个大斑病抗性记录的美国玉米自交系作为材料，经试验鉴定，其中感大斑病的有64个自交系，抗大斑病的51个自交系；

（2）使用Illumina公司开发的玉米Infinium50K高密度商业芯片测量115个玉米自交系的高密度指纹，使用TASSEL软件

http://www.maizegenetics.net/index.php?option=com_content&task=view&id=89&Itemid=119对测得的115个自交系的高密度指纹进行了聚类分析；

（3）玉米抗大斑病主效QTL的全基因组扫描定位，对步骤（1）所得的玉米抗大斑病性状结果和步骤（2）所得的基因型数据，使用TASSEL中的MLM算法进行了分析。

（4）选取10个互不连锁的QTL,发现以下SNP位点与抗玉米大斑病有关，

PZE-109053835

PZE-103102855

SYN12735

SYN18302

SYN30756

PZE-103171599

SYN30351

PZE-104141072

PZE-108071872

PZE-110066840

。

4.权利要求1所述玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记在抗玉米大斑病的早期预测和筛选中的应用。

5.权利要求1所述玉米种质抗大斑病QTL的SNP分子标记在抗玉米大斑病型玉米的选育的应用。