[发明专利]包括1009C>A突变的CYP2C9基因片段、所编码的蛋白质片段及其应用

权利要求书

1.核酸片段，所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.1的第1001位的突变位点，且是SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸，其中第1001位的核苷酸是A；或者所述核酸片段包含对应于SEQ ID NO.2的第1009位的突变位点，且是SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸，其中第1009位的核苷酸是A；或者为所述核酸片段的互补序列。

2.根据权利要求1所述的核酸片段，其特征在于，所述核酸片段的长度是10-100、100-200、200-500或500-1000个核苷酸；优选地，所述核酸片段的长度是10-20、20-30、30-40、40-50、50-60、60-100或100-300个核苷酸；进一步优选地，所述核酸片段是SEQ ID NO.1、2、24-31所示的序列。

3.等位基因特异性寡核苷酸，所述寡核苷酸与含有对应于SEQ ID NO.1的第1001位或对应于SEQ ID NO.2的第1009位的突变位点的等位基因片段或其互补序列全部或部分杂交，其中SEQ ID NO.1的第1001位或SEQ ID NO.2的第1009位的突变位点的核苷酸是A；所述等位基因片段是SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列中的至少10个连续核苷酸或其互补序列。

4.根据权利要求3所述的等位基因特异性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是探针或引物；优选地，当所述寡核苷酸是探针时，所述寡核苷酸的长度是5-100个核苷酸；当所述寡核苷酸是引物时，所述寡核苷酸的长度是15-40个核苷酸；优选地，当所述寡核苷酸是探针时，所述突变位点位于探针序列的中心或大约中心处；当所述寡核苷酸是引物时，所述突变位点位于引物的3’末端。

5.根据权利要求4所述的等位基因特异性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是如SEQ ID NO.32-38所示的序列。

6.用于检测和/或分析单碱基突变的试剂盒，包括权利要求1或2所述的核酸片段和/或权利要求3-5任一项所述的等位基因特异性寡核苷酸；或者包含SEQ ID NO.12和/或SEQ ID NO.13和/或SEQ ID NO.21所示的序列片段。

7.权利要求1或2所述的核酸片段和/或权利要求3-5任一项所述的等位基因特异性寡核苷酸在检测CYP2C9基因突变中的应用，其中所述核酸片段或寡核苷酸用作探针或引物。

8.一种用药指导，包括检测待测样品中CYP2C9基因的对应于SEQ ID NO.1的第1001位或SEQ ID NO.2的第1009位的单碱基突变；根据检测到的突变，调整经CYP2C9代谢的药物的给药量；优选地，所述药物是环磷酰胺、异环磷酰胺、紫杉醇、华法林、醋硝香豆素、美芬妥英、甲苯磺丁脲、那格列奈、吡格列酮、罗格列酮、苯妥英、唑尼沙胺、阿莫地喹、盐酸氯胍、奎宁、阿米替林、西酞普兰、丙咪嗪、哌罗匹隆、舍曲林、硫利达嗪、文拉法辛、氯沙坦、厄贝沙坦、缬沙坦、双氯芬酸、氨基比林、安替比林、塞来昔布、氟比洛芬、布洛芬、吲哚美辛、氯诺昔康、甲芬那酸、萘普生、吡罗昔康、替诺昔康、洛哌丁胺、美沙酮、吗啡、兰索拉唑、奥美拉唑、氯巴占、甲苯比妥或佐匹克隆。

9.一种分析核酸的方法，包括分析待测样品中的包含对应于SEQ ID NO.1的序列的核酸中对应于第1001位的核苷酸或分析待测样品中的包含对应于SEQ ID NO.2的序列的核酸中对应于第1009位的核苷酸；优选地，所述方法是测序法、限制性片段长度多态性分析或探针杂交法。

10.CYP2C9蛋白或其片段或变异体，所述蛋白序列为SEQ ID NO.3所示的序列；所述片段或变异体包含对应于SEQ ID NO.3的第337位的苏氨酸，并且为SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列的至少10个连续氨基酸。