[发明专利]新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用

权利要求书

1.一种分离的短串联重复序列基因座G7S0005，其特征在于，所述基因座的序列如SEQ ID NO.:1所示，其用于制备：

(a) 用于遗传关系分析的试剂或试剂盒；

(b) 用于个体识别的试剂或试剂盒；

(c) 用于亲子鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒；

(d) 用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或

(e) 用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。

2.一种分离的核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列的结构如下：

X1-X2-X3

式中，X1 为 SEQ ID NO.:2 中第 1-800 位；

X2 为含有≥6 个重复单元 taga 的遗传多态区，并且所述的遗传多态区是 SEQ ID NO.: 1 所示的多核苷酸，或者所述的遗传多态区是在 SEQ ID NO.: 1 基础上缺失或插入一个或几个重复单元而形成的多核苷酸，并且所述重复单元为 taga；

X3 为 SEQ ID NO.:2 中第 865-1644 位。

3.如权利要求1所述的分离的短串联重复序列基因座G7S0005，其特征在于，所述的试剂包括(i)引物或引物对；(ii) 探针；(iii) 核酸芯片。

4.如权利要求3所述的分离的短串联重复序列基因座G7S0005，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示。

5.一种特异性扩增短串联重复序列基因座G7S0005的引物对，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQ ID NO.: 3和SEQ ID NO.:4所示。

6.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括：

(a) 用于特异性扩增短串联重复序列基因座G7S0005的引物对，所述引物对 的序列如 SEQ ID NO.: 3 和 SEQ ID NO.:4 所示；和

(b) 使用说明书。

7.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括(c)特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。

8.一种扩增体系，其特征在于，所述扩增体系包括：

(a) 用于特异性扩增短串联重复序列基因座G7S0005的引物对，所述引物对 的序列如 SEQ ID NO.: 3 和 SEQ ID NO.:4 所示；和

(b) 任选的、特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；

并且所述引物对(a)和任选的引物对(b)位于同一扩增体系。

9.如权利要求8所述的扩增体系，其特征在于，所述的扩增体系为复合扩增体系，其中，所述的引物对(b)包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，或16对特异性引物对；和/或

所述复合扩增体系为荧光标记的复合扩增体系，其中，所述荧光标记是指选用下组的一种或多种荧光标记试剂标记所述基因座的引物：FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD-700/800、CY3、CY5、CY3.5、CY5.5、TET、TAMRA、JOE、BODIPY TMR、俄勒冈绿、罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。

10.一种扩增方法，其特征在于，包括步骤：

在权利要求8-9中任一所述的扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物。

11.一种遗传关系分析方法，其特征在于，包括步骤：

(1)在权利要求8-9中任一所述的扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物；和

其中，所述待检测样本包括分别来自不同个体的核酸样本S1,S2,……,Si，式中i为≥2的正整数；

(2)对来自不同核酸样本S1,S2,……,Si的基因座扩增产物进行检测，从而获得对应于不同核酸样本的检测结果；

(3) 对步骤(2)获得的检测结果进行比较，从而确定不同个体之间的遗传关系。