[发明专利]茄子控制果实形状相关的OVATE基因序列无效
申请号: | 201310135852.7 | 申请日: | 2013-04-18 |
公开(公告)号: | CN103205438A | 公开(公告)日: | 2013-07-17 |
发明(设计)人: | 陈火英;韩洪强;刘杨;蒋明敏;刘冬媛;周晓晨 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C07K14/415 |
代理公司: | 上海新天专利代理有限公司 31213 | 代理人: | 祖志翔 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 茄子 控制 果实 形状 相关 ovate 基因 序列 | ||
技术领域
本发明涉及的是一种生物技术领域的基因序列,具体涉及一种与茄子控制果实形状相关的OVATE基因序列。
背景技术
果实的形状多种多样,其因为与果实重量具有密不可分的关系而受到生物学家、遗传学家和育种家的重视。在对果实形状研究的物种中,番茄由于在世界范围内被大家食用而受到青睐,因而作为茄科的模式植物来研究。目前已经分离克隆的关于果实形状的基因SUN、OVATE、LC和FAS基因的首次报道都来自番茄。番茄OVATE基因作为一种调控基因,在该基因编码序列发生突变,终止子提取时,产生梨形的果实,这样的果型是在杂交亲本中所没有的。在辣椒上,嫁接导致果实的变长是比较常见的现象,而通过对辣椒OVATE基因表达的分析,发现扁圆形和长形辣椒的差异在于OVATE基因的表达量高低上。对辣椒OVATE基因的干扰,使得扁圆形辣椒伸长,变成长形的辣椒,果型发生了极大的变化。
茄子虽然具有比番茄更多的果实形状,但相关研究相对滞后,果实形状相关基因的序列及研究尚未见报道。在基于番茄和辣椒等研究的基础上,对茄子果型相关OVATE基因的研究既可行,又能从另一角度丰富OVATE基因的相关内容。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供一种茄子控制果实形状相关的OVATE的基因序列,以便通过对该基因表达的调控及干扰等操作,实现对茄子果实形状的改变。
本发明的技术方案是:
一种茄子控制果实形状相关的OVATE基因序列,其具有SEQ ID NO.1中从核苷酸第1-1077位所示的核苷酸序列。
所述的基因序列编码的多肽具有SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列。
本发明的另一技术方案是:
一种茄子控制果实形状相关的OVATE基因序列,其具有SEQ ID NO.2中从核苷酸第1-1077位所示的核苷酸序列。
所述的基因序列编码的多肽具有SEQ ID NO.3所示的氨基酸序列。
本发明根据茄科模式植物番茄的ovate序列,采用同源克隆的方式获得了茄子OVATE基因,该茄子OVATE基因的cDNA全长1192bp,基因编码区长1077bp。基因组序列长1659bp,它包括1个内含子和2个外显子,第一个外显子长689bp,第二个外显子长388bp,中间的内含子长467bp。在OVATE基因起始密码子上游有48bp的非编码区,终止子下游有67bp的非编码区。OVATE基因编码一个358个氨基酸,该氨基酸序列具有OVATE超基因家族的结构域。OVATE基因及其推导的氨基酸序列为:
CGATTAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGAGACAAAAAGAATGGGAAAAAGCTTCAAGCTTCGGTTCTCCAGAGTTATGGCT
M G K S F K L R F S R V M A
TCTTTCAACACCTGCCGTTCCAAGGAGCCTTCTTCTCTTCCCCAAAATCCTAATTTCTTCCCGCATAGTAACAATAAGCTCAGTTGTACA
S F N T C R S K E P S S L P Q N P N F F P H S N N K L S C T
AAACTCATCTCCTCCGATTTCCATCTTATCGATCAAAATCAAAATCCCCGTAATTATAATTACGTGCCGGAATCCATGATGATCTCCGTT
K L I S S D F H L I D Q N Q N P R N Y N Y V P E S M M I S V
GGCTGTAGGCCAGAATTCAAGTGGGAGAAAGAAGAGAAGTTTCACGTGGTTTCCAGCTCGTTCGTCTCCGAAGAAGAAGAAGAGGAGGAG
G C R P E F K W E K E E K F H V V S S S F V S E E E E E E E
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