[发明专利]通过杂交进行的随机阵列DNA分析

权利要求书

1.一种用于分析靶核酸的系统，所述系统包含：

（a）反应平台；

（b）所述平台表面上的阵列，其中，所述阵列含有多个区域，各区域设置成用于固定所述靶核酸的片段；

（c）设置成用于激发在所述表面上或靠近所述表面的荧光分子的光源；

（d）置于所述反应平台上方的兆像素相机；

（e）设置成用于聚焦平台区域的透镜，这样所述阵列的每个区域被聚焦于该相机的单个像素上。

2.如权利要求1所述的系统，其特征在于，每个区域是1微米。

3.如权利要求1所述的系统，其特征在于，所述阵列含有一百万个以上1微米的区域。

4.如权利要求1所述的系统，其特征在于，所述光源是激光，所述系统还包括用于控制来自激光器的光的电流计。

5.如权利要求1－4中任一项所述的系统，其特征在于，所述系统包含以每个像素大约一个片段的密度固定在所述表面上的所述靶核酸的片段。

6.如权利要求5所述的系统，其特征在于，所述系统包含与所述靶核酸的片段杂交的荧光标记的探针。

7.一种分析靶核酸的方法，其特征在于，所述方法包括：

（a）消化所述靶核酸，产生片段；

（b）以每像素一个片段的平均密度将阵列的所述片段排列到权利要求1－4中任一项所述的系统的反应平台上；

（c）使用第一信息探针库对所述阵列实施通过杂交进行的基于随机DNA阵列的测序（rSBH）；

（d）记录来自各像素的信号；

（e）从所述阵列除去所述第一信息探针库；和

（f）使用不同的信息探针库对所述阵列实施第二轮的rSBH。

8.如权利要求7所述的方法，其特征在于，所述步骤（c）和（d）包括照明的同时孵育少于1分钟，并以每秒1-10帧进行信号监测。

9.如权利要求7所述的方法，其特征在于，所述方法还包括使用计算机将信息性荧光信号转换成组装的序列数据。

10.如权利要求7所述的方法，其特征在于，所述方法是个体人类基因组的全基因组测序方法。