[发明专利]一种检测甲型流感病毒H7N9亚型的荧光定量RT-PCR试剂盒有效
申请号: | 201310149240.3 | 申请日: | 2013-04-25 |
公开(公告)号: | CN103275862A | 公开(公告)日: | 2013-09-04 |
发明(设计)人: | 李兰娟;陈瑜;谢国良;崔大伟;霍朝霞;杨先知;郑书发;李雪芬 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12M1/00 | 分类号: | C12M1/00;C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 张法高;赵杭丽 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 流感病毒 h7n9 荧光 定量 rt pcr 试剂盒 | ||
1.一种检测甲型流感病毒H7N9亚型的荧光定量RT-PCR试剂盒,其特征在于,该试剂盒由定量RT-PCR反应液管(1)、酶混合液管(2)、引物探针混合液管(3)、4个标准品管(4)、4个阳性对照品管(5)、阴性对照品管(6)和盒体(7)组成,定量RT-PCR反应液管(1)装有定量RT-PCR反应液,酶混合液管(2)装有酶混合液,引物探针混合液管(3)装有引物探针混合液,4个标准品管(4)分别装有甲型流感病毒、H7、N9、RNase P,4个阳性对照品管(5)分别装有甲型流感病毒、H7、N9、RNase P的阳性质粒样品;
其中定量RT-PCR反应液含有PCR反应缓冲液、氯化镁和三磷酸脱氧核糖核苷酸混合物,酶混合液含耐热Taq DNA聚合酶、RNA酶抑制剂和MMLV逆转录酶,引物探针混合液包含四组引物和相应的四种不同荧光标记的探针,阴性对照为高温高压灭菌的焦碳酸二乙酯处理水,阳性对照为甲型流感病毒、H7、N9、RNase P的阳性质粒样品;
荧光定量RT-PCR检测用上游引物和下游引物以及相应的特异性探针序列如下:
上游引物Influenza A-F: 5’- GGARTGGMTAAAGACAAGACCAATC-3’
下游引物Influenza A-R:5’- GGCRTTYTGGACAAASCGTCTAC-3’
特异性探针Influenza A-P: 5’-ROX-AGTCCTCGCTCACTGGGCACGGT-BHQ2-3’
上游引物H7-F: 5’- GAGGCRATGCAAAATAGAATACAGAT-3’
下游引物H7-R: 5’- CCGAAGCTAAACCARAGTATCACA-3’
特异性探针H7-P: 5’-FAM- ACCCRGTCAAACTAAGCAGCGGYTAYAA--BHQ1-3’
上游引物N9-F: 5’- GCCCTGATAAGCTGGCCACT-3’
下游引物N9-R: 5- ACTAGTACTTGACCAMCCAATGCA-3’
特异性探针N9-P: 5’-VIC- TCACCRCCCACAGTRTACAAYAGCA-BHQ1-3’
上游引物RNase P-F: 5’- AGATTTGGACCTGCGAGCG-3’
下游引物RNase P-R:5’- GAGCGGCTGTCTCCACAAGT-3’
特异性探针RNase P-P: 5’-CY5- TTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCG-BHQ2-3’
所述标准品包括甲型流感病毒、H7、N9及核酶RNase P标准品,其保守区基因序列如下:
甲型流感病毒标准品序列为:
CGAGGCTCTCATGGAGTGGCTAAAGACAAGACCAATCCTGTCACCTCTGACTAAGGGGATTTTAGGGTTTGTGTTCACGCTCACCGTGCCCAGTGAGCGAGGACTGCAGCGTAGACGCTTTGTCCAAAACGCCCTAAATGGGAATGG
H7标准品序列为:
CACAGCAAATACAGGGAAGAGGCAATGCAAAATAGAATACAGATTGACCCAGTCAAACTAAGCAGCGGCTACAAAGATGTGATACTTTGGTTTAGCTTCGGGGCATCATGTTTCATACT
N9标准品序列为:
GATAGGTCCCAGTATCGCGCCCTGATAAGCTGGCCACTATCATCACCGCCCACAGTGTACAACAGCAGGGTGGAATGCATTGGGTGGTCAAGTACTAGTTGCCATGATGGCAAATCCAGG
RNase P标准品序列为:
CTTCAGCATGGCGGTGTTTGCAGATTTGGACCTGCGAGCGGGTTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCGGACTTGTGGAGACAGCCGCTCACCTTGGCTATTCAGTGGTTGC
所述甲型流感病毒、H7、N9及RNase P的特异性探针分别采用ROX、FAM、VIC和CY5四种不同荧光标记。
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