[发明专利]一种单、多元变量相结合的数据分析方法无效
申请号: | 201310171202.8 | 申请日: | 2013-05-10 |
公开(公告)号: | CN103714233A | 公开(公告)日: | 2014-04-09 |
发明(设计)人: | 徐捷;其他发明人请求不公开姓名 | 申请(专利权)人: | 上海阿趣生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200433 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多元 变量 相结合 数据 分析 方法 | ||
1.一种基于复杂分析仪器的单﹑多元变量相结合的数据分析方法(XMS),它包括四部分:一,对多样本初始数据缺失值的填补,异常值的筛选,归一化等数据预处理;二,数据分析:主成分分析(PCA),偏最小二乘法判别分析(PLS-DA),正交最小二乘法分析(OPLS);三,自动生成两组样本之间倍数变化关系值(FOLD CHANGE),学生T检验TTEST值(p-value),变量重要性variable importance值(VIP)等差异物筛选特征值表格;四,以图表等直观的表现方法通过压缩文件夹形式导出所需数据处理结果result.zip。其特征在于将复杂的生命信息数据简单化,解决目前数据分析方法获取生命信息量不足的缺点,将多样本特征数据整合成直观图表形式展现并输出。
2.基于权利要求一所述数据分析方法可用于分析气质联用(GC-MS),液质联用(LC-MS),核磁共振(NMR)等分析仪器所导出的原始数据,其特征在于适用于目前检测分析主流的仪器,应用广泛,操作简便。
3.基于权利要求一所述数据分析方法,可用于生命潜在标记物筛选,其特征在于可由科研人员自行选择筛选条件以及阈值的设定,所得差异物特征图(Differential feature plot)直观形象。
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G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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