[发明专利]检测与抗病毒感染性有关的基因OAS1中的突变的方法

说明书

本申请是申请号为200480038606.9(第一分案申请的申请号201110036354.8)，申请日为2004年10月22日，申请人为伊洛默格生物科学公司，发明名称为“检测与抗病毒感染性有关的基因OAS1中的突变的方法”的中国发明专利的分案申请。 

技术领域

本发明涉及一种用于检测人类寡腺苷酸合成酶基因中的突变的方法及所编码的蛋白质及其抗体的用途，其中突变赋予对黄病毒感染(包括C型肝炎感染)的抗性，且突变与包括前列腺癌和糖尿病的其他病状有关。 

背景技术

迄今为止已鉴别许多疾病，其中人类群体中存在天然的感染抗性。Alter和Moyer，J.Acquir.Immune Defic.Syndr.Hum Retrovirol.18增刊1：S6-10(1998)报导在诸如注射药物使用者的高危群组中的C型肝炎病毒感染(HCV)高达90％。然而，尚未有文献确认剩余的10％明显对抗感染的机制为何。在HCV感染中起作用的蛋白质包括2-端、5-端寡腺苷酸合成酶。OAS是干扰素诱导的蛋白质，其特征为能催化2-端、5-端腺苷寡聚物(2-5A)的合成。Hovanessian等人，EMBO6：1273-1280(1987)发现经干扰素治疗的人类细胞含有数种与40(OAS1)、46(OAS1)、69及100kD的蛋白质对应的OAS。Marie等人，Biochem.Biophys.Res.Commun.160：580-587(1989)产生高度特异性的抗p69(69-kD OAS)多克隆抗体。通过以抗p69抗体筛检经干扰素治疗的人类细胞表达文库，Marie和Hovanessian，J.Biol.Chem.267：9933-9939(1992)分离出部分OAS2 cDNA。他们以部分cDNA筛检另外的文库并回收编码两个OAS2同功异型物(isoform)的cDNA。较小的同功异型物由两个3-端未转译区长度不同的mRNA编码。 

Northern印迹分析揭示OAS2表达为人类细胞中四个由干扰素诱导的mRNA。所预测的OAS2蛋白质具有共同的683-氨基酸序列及不同的3-端末端。根据活体外转录/转译产物的SDS-PAGE，两个同功异型物的分子质量为69和71kD。两个同功异型物在活体外均显示出OAS活性。序列分析表明OAS2含有两个由富含脯氨酸的假定连接子区所分隔的OAS1同源域。N末端及C末端域分别为41％和53％相同于OAS1。 

通过荧光原位杂交和通过包含于定位克隆之内，Hovanian等人，Genomics52：267-277(1998)确定OAS1、OAS2和OAS3基因是由12q24.2上的130-kb区丛集。2-5A结合至降解病毒及细胞RNA的核糖核酸酶I并激活其，从而导致细胞蛋白质合成的抑制和病毒复制的削弱。 

被称为OASL的第四种人类OAS基因与OAS1、OAS2和OAS3的不同在于OASL缺乏酶活性。OASL基因编码双域蛋白质，其是由融合至与泛素的串联重复同源的164-氨基酸C末端域的OAS单元组成。(Eskildsen等人，Nuc.Acids Res.31：3166-3173，2003；Kakuta等人，J.Interferon＆Cytokine Res.22：981-993，2002) 

由于其在抑制病毒复制和病毒感染中的作用，因此此项技术中需要抑制与OAS1活性有关的病毒复制的方法和组合物，包括进一步需要抑制HCV复制的基于抑制剂的疗法。 

发明内容

本发明涉及检测与C型肝炎抗性有关的突变，所述突变的特征在于其为寡腺苷酸合成酶1基因中的点突变。 

在一实施例中，涵盖一种人类基因筛检方法。所述方法包含对分离自人类的核酸样本分析寡腺苷酸合成酶1基因点突变的存在，所述点突变的特征为在根据Genbank序列登记号第NT_009775.13号(连续核苷酸2,130,000-2,157,999，其以SEQ ID NO：19显示于图2中)的寡腺苷酸合成酶1基因(OAS1)的2135728、2135749、2135978、2144072、2144088、2144116、2144321、2131025、2133961、2139587、2144294、2144985、2156523或2156638核苷酸位置处的碱基取代或在2156595核苷酸位置处的碱基缺失。